Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  77  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20693031--20693176
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20
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20
3.5
20
76
6
59
57
4
8
28
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.52
20752393--20752441
20
2.3
23
82
10
59
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16
2
55
1.52
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2.2
21
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2
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0
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20799224--20799263
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0
2
52
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3
2
46
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1.9
23
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2
44
1.35
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3.8
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27
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2.0
62
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18
24
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1.98
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3.7
46
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3
184
26
15
28
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20809745--20809792
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4.2
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189
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1.85
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2.0
66
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20
31
1.83
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66
1.9
66
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150
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12
22
27
1.91
20812575--20812688
33
3.5
33
76
8
90
37
9
23
28
1.87
20812599--20812715
33
3.5
33
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112
35
12
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26
1.92
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0
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0
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1.79
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1.64
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2.2
45
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3
132
41
19
17
20
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20852481--20852834
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43
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2
304
29
16
24
28
1.97
20852508--20852816
128
2.4
127
82
4
372
31
17
23
27
1.97
20852481--20852834
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4.1
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79
2
370
29
16
24
28
1.97
20852481--20852826
171
2.0
171
81
5
394
30
16
24
28
1.97
20855631--20855661
6
5.2
6
96
0
53
29
48
22
0
1.51
20855633--20855671
12
3.2
12
88
0
51
25
48
23
2
1.63
20856364--20856435
33
2.1
35
84
5
94
45
16
8
29
1.76
20859366--20859412
3
15.7
3
79
16
53
63
2
4
29
1.25
20859366--20859413
18
2.7
18
90
3
71
64
2
4
29
1.23
20862001--20862032
11
2.8
12
86
13
50
34
0
0
65
0.93
20862248--20862290
22
2.0
22
90
0
68
58
9
11
20
1.61
20862256--20862295
11
3.6
11
79
0
53
57
7
15
20
1.61
20864717--20864743
4
6.8
4
100
0
54
77
0
0
22
0.76
20866620--20866688
21
2.9
25
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22
76
31
0
7
60
1.24
20866626--20866682
21
2.7
21
94
2
96
29
0
8
61
1.26
20870755--20870779
10
2.5
10
100
0
50
64
0
0
36
0.94
20879093--20879138
18
2.5
20
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13
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52
0
6
41
1.27
20879841--20879945
53
2.0
53
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3
131
45
9
1
42
1.47
20883109--20883134
13
2.0
13
100
0
52
23
0
46
30
1.53
20884177--20884216
17
2.4
17
87
4
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32
0
0
67
0.91
20892419--20892513
40
2.4
40
98
0
181
29
30
20
20
1.97
20900860--20900992
40
3.4
40
92
4
234
30
29
19
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20903430--20904782
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2.0
675
97
0
2544
27
17
21
33
1.96
20909170--20909206
14
2.6
14
86
0
56
72
5
2
18
1.15
20916539--20916610
9
8.2
9
74
9
60
36
0
15
48
1.45
20916743--20916901
9
17.7
9
67
21
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38
2
15
44
1.60
20916784--20916841
16
3.5
15
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11
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1
18
43
1.61
20916999--20917469
99
4.8
99
94
1
795
51
3
6
37
1.47
20916921--20917469
197
2.7
198
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5
800
51
3
7
37
1.47
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2.2
12
100
0
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1.73
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2.3
77
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28
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1.96
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5.3
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20
22
19
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1.95
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2.3
15
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0
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0
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100
0
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0
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1.9
16
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0
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9
9
9
70
1.33
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29
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23
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25
21
19
1.97
20941101--20941203
50
2.1
50
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0
179
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20
22
1.96
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20
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3
2
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1.29
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5
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6
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42
2
2
52
1.28
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16
2.2
16
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0
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0
0
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0.99
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2.0
32
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0
81
39
6
9
44
1.62
20946745--20946815
32
2.2
32
79
2
79
40
5
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1.61
20948018--20948047
7
4.3
7
100
0
60
30
26
13
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20951815--20951853
21
2.0
19
85
14
53
56
5
0
38
1.22
20957063--20957172
50
2.2
51
88
6
170
23
18
6
51
1.68
20971518--20971554
2
18.5
2
100
0
74
51
0
0
48
1.00
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20
2.2
21
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69
6
6
17
1.32
20974027--20974062
17
2.1
17
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0
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30
2
5
61
1.33
20974234--20974275
15
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0
0
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0.89
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1
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100
0
50
32
32
0
36
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378