Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  21  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5616401--5616440
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0
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2.5
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0
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1.9
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2.1
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0
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17
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22
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35
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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13
2.3
13
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10
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10
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1
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15
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0
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0
0
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1.93
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31
3.8
31
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27
19
27
25
1.99
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47
2.7
46
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1
156
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13
27
30
1.94
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42
2.7
42
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2
160
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14
24
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1.95
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25
2.3
25
100
0
114
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26
19
1.79
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7
53
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0
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20
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2.7
47
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175
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21
23
24
1.99
5700327--5700588
44
5.9
44
72
9
156
30
17
22
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
19
30
1.97
5700418--5700700
89
3.2
89
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19
19
31
1.96
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18
27
1.95
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75
7
126
32
18
19
28
1.96
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14
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15
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4
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1.14
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1
63
1.18
5711119--5711217
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10
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3
1
62
1.17
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3.2
21
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19
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33
2
1
61
1.19
5711130--5711217
16
4.6
20
71
22
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2
1
62
1.15
5711121--5711222
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2.2
46
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14
122
33
2
0
62
1.17
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16
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0
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0.92
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14
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1
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1.04
5711111--5711229
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1.18
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169
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2
925
28
19
19
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5729915--5730087
94
1.8
94
83
2
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27
21
19
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1.98
5729987--5730153
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2.1
78
86
3
228
28
20
18
32
1.96
5730067--5730245
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2.0
91
86
3
252
27
18
17
35
1.94
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76
2.1
77
82
7
187
28
17
18
34
1.94
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78
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77
75
15
274
29
17
18
34
1.94
5731878--5731920
12
3.4
12
75
12
50
0
11
6
81
0.87
5734805--5734847
2
22.0
2
85
4
52
51
0
0
48
1.00
5734760--5734841
42
1.9
43
82
7
105
47
1
2
48
1.22
5734793--5734845
23
2.3
23
76
0
61
49
0
0
50
1.00
5736714--5736758
2
22.5
2
95
0
81
48
0
2
48
1.13
5737507--5737564
29
2.0
29
100
0
116
41
17
20
20
1.90
5741514--5741574
31
2.0
31
83
0
77
31
6
8
54
1.56
5742013--5742042
15
2.0
15
100
0
60
60
6
6
26
1.47
5746804--5746861
17
3.5
17
69
19
50
53
0
3
43
1.17
5759791--5759823
13
2.4
14
85
5
50
57
0
0
42
0.98
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13
2.9
13
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11
53
53
0
5
41
1.23
5761743--5761866
32
3.7
33
79
14
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49
4
8
37
1.54
5761749--5761869
35
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33
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8
140
47
4
8
38
1.55
5763205--5763242
17
2.1
19
90
9
62
44
5
0
50
1.24
5764297--5764374
31
2.6
30
83
6
86
50
12
3
33
1.59
5766037--5766072
16
2.3
16
95
4
65
72
5
2
19
1.17
5766845--5766932
8
12.0
7
71
19
56
55
3
0
40
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5766887--5766928
14
2.9
14
86
10
50
59
4
0
35
1.19
5767055--5767134
28
2.9
27
80
12
90
56
2
16
25
1.53
5767072--5767134
14
4.5
14
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0
54
55
3
15
25
1.55
5771055--5771092
19
1.9
19
89
5
58
50
2
2
44
1.30
5771055--5771099
19
2.3
19
84
7
54
48
2
4
44
1.35
5777993--5778051
21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
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1.15
5778022--5778071
26
2.0
24
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7
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30
0
6
64
1.18
5778633--5778678
15
2.9
16
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12
58
69
0
0
30
0.89
5778600--5778670
27
2.5
29
76
19
87
63
1
0
35
1.03
5781592--5781653
27
2.3
26
76
13
63
48
11
1
38
1.49
5783430--5783681
130
1.9
130
89
3
391
36
16
18
28
1.93
5784815--5784859
2
22.5
2
100
0
90
51
0
0
48
1.00
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9
3.7
9
95
0
57
39
12
18
30
1.87
5785831--5785876
9
5.0
9
89
2
56
39
15
15
30
1.88
5786239--5786286
24
2.0
24
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0
87
27
45
4
22
1.70
5793869--5793941
36
2.0
36
97
0
137
36
17
8
36
1.80
5797204--5797244
19
2.2
19
95
4
75
19
0
9
70
1.14
5799900--5799993
26
3.4
26
69
18
82
54
3
5
37
1.39
5799900--5800014
57
2.0
57
96
0
212
53
2
7
35
1.44
5804107--5804394
159
1.8
158
85
3
409
31
10
11
46
1.74
5807299--5807341
22
2.0
22
95
0
77
27
25
20
25
1.99
5811396--5811448
27
2.0
27
84
0
70
73
5
11
9
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5812246--5812286
16
2.8
15
82
14
50
60
2
0
36
1.10
5812522--5812547
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
5815435--5815492
25
2.2
24
80
14
62
58
1
1
37
1.18
5819618--5819677
31
2.0
30
90
3
93
66
0
5
28
1.12
5819926--5819998
8
9.4
8
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15
55
23
0
1
75
0.88
5819926--5819993
24
2.9
23
87
10
93
25
0
1
73
0.92
5819926--5820001
15
4.9
15
72
18
57
25
0
1
73
0.91
5819926--5819993
23
2.9
24
85
10
95
25
0
1
73
0.92
5820095--5820158
20
3.1
20
76
17
60
42
4
1
51
1.32
5820108--5820158
20
2.4
22
83
6
70
41
3
1
52
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378