Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  56  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.13
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4.3
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38
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1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.57
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1.62
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1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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28
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28
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3
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1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
14261857--14261958
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1.50
14263618--14263763
48
3.0
48
86
4
197
19
16
29
34
1.94
14280283--14280315
6
5.5
6
96
0
57
15
3
0
81
0.80
14280283--14280322
18
2.2
18
86
0
53
17
5
0
77
0.94
14281823--14281992
46
3.7
45
78
7
198
28
28
20
22
1.98
14281825--14282014
46
4.1
46
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21
119
28
28
20
22
1.98
14297623--14297669
18
2.6
18
76
6
51
19
8
0
72
1.10
14313603--14313690
23
3.9
24
71
10
69
29
23
15
30
1.96
14320628--14320719
23
4.0
23
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1
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26
22
17
33
1.96
14322639--14322794
56
2.8
54
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3
186
19
18
32
28
1.96
14327586--14327742
43
3.7
43
81
12
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32
24
17
24
1.97
14327586--14327748
44
3.8
42
77
14
154
33
24
17
24
1.97
14327586--14327742
86
1.8
85
82
6
201
32
24
17
24
1.97
14343967--14344068
18
5.8
18
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6
102
33
20
9
36
1.86
14343967--14344050
33
2.5
33
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5
105
34
21
8
35
1.84
14343968--14344070
51
2.0
51
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0
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33
21
9
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1.86
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2
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2
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0
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0
0
50
1.00
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50
2.3
50
87
1
158
26
26
7
40
1.83
14355373--14355444
25
2.8
26
79
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76
23
22
20
33
1.97
14355373--14355460
25
3.6
25
75
9
74
22
22
20
34
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14366093--14366143
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2.2
22
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10
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35
7
19
37
1.81
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50
7.8
50
75
4
331
27
18
24
30
1.98
14374691--14375080
101
3.9
101
75
6
263
26
18
24
30
1.98
14374690--14375080
151
2.6
151
88
0
604
26
18
24
30
1.98
14375283--14375314
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2.0
16
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0
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0
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1.49
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1.76
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4.2
27
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23
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1.94
14379252--14379366
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2.1
54
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23
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1.94
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0
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1.97
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101
5.4
100
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5
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25
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1.97
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151
3.6
151
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0
872
26
17
25
31
1.97
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2.0
16
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0
55
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0
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2.2
18
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0
0
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0
0
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28
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4.0
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7
71
14
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11
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0
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40
0
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14
2.0
15
93
6
51
20
6
6
65
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14434758--14434881
55
2.3
55
79
8
135
25
28
28
18
1.98
14437383--14437413
14
2.3
13
94
5
53
19
6
12
61
1.53
14444546--14444585
15
2.7
15
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55
77
0
10
12
0.99
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2.0
24
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4
2
32
1.28
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3.3
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20
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1
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1.36
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4.5
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9
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2.0
19
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2.2
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208
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9
3.0
9
100
0
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33
0
33
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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