Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  85  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23127421--23127486
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32
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2.8
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1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.50
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4.4
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26
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33
1.95
23151686--23151842
41
3.9
41
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4
185
24
17
22
35
1.95
23151468--23151842
122
3.1
121
81
5
403
25
15
24
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4.4
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7
39
1.81
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2.9
81
81
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30
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2.0
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19
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1.95
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100
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163
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115
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407
37
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13
26
1.91
23156161--23156517
29
12.4
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12
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1.91
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4.7
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366
36
23
13
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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20
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20
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1.95
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21
21
1.96
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19
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18
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18
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125
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1
3
36
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23202550--23207766
570
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15
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21.5
2
95
0
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0
2
48
1.14
23219235--23219497
134
2.0
134
85
0
355
34
19
10
35
1.86
23221220--23221313
47
2.0
47
93
0
161
30
15
12
40
1.85
23220701--23221884
618
1.9
617
81
4
1447
33
15
16
34
1.91
23221390--23222480
543
2.0
543
88
2
1627
32
16
16
34
1.92
23221541--23222872
570
2.4
547
82
7
1520
32
15
17
34
1.92
23222621--23223104
263
1.8
263
82
2
614
33
14
19
33
1.91
23222051--23223673
833
1.9
831
81
4
1908
32
16
16
34
1.92
23224824--23224902
39
2.0
39
100
0
158
25
25
17
31
1.97
23227238--23227404
40
4.2
39
80
6
149
25
23
26
24
2.00
23227294--23227429
40
3.4
40
85
7
170
25
22
27
25
2.00
23236082--23236273
40
4.8
39
82
5
172
24
22
28
24
2.00
23236082--23236273
79
2.4
81
84
6
241
24
22
28
24
2.00
23236082--23236298
79
2.7
78
80
9
217
24
22
27
25
2.00
23239062--23239631
287
2.0
288
86
2
788
31
18
13
36
1.90
23244384--23245804
536
2.6
541
83
5
1645
33
15
16
33
1.91
23249494--23249773
134
2.1
134
82
1
337
32
19
11
36
1.88
23250183--23250442
134
1.9
134
82
4
328
33
18
10
38
1.84
23250183--23250478
134
2.2
134
80
5
314
34
17
10
37
1.84
23251870--23252223
134
2.6
134
81
1
388
31
19
12
36
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23253355--23253596
134
1.8
134
83
1
324
32
19
11
37
1.87
23253317--23253651
134
2.5
131
77
6
323
31
18
11
37
1.88
23253599--23254344
398
1.9
398
85
1
1030
35
16
16
31
1.91
23255768--23255846
33
2.4
33
84
0
104
27
26
29
16
1.97
23258940--23259010
20
3.5
20
98
1
133
54
5
4
35
1.43
23259067--23259192
25
5.3
23
73
22
86
55
7
3
33
1.46
23259076--23259128
20
2.7
20
85
11
65
56
7
1
33
1.38
23259129--23259194
27
2.5
26
83
11
82
54
6
6
33
1.50
23259231--23259293
27
2.4
25
78
19
65
60
3
6
30
1.37
23259749--23259788
19
2.1
19
86
9
55
65
0
2
32
1.06
23259749--23259800
25
2.0
28
82
17
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61
1
3
32
1.25
23265239--23265278
18
2.3
17
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4
53
12
15
42
30
1.83
23277948--23278240
134
2.2
135
83
3
358
30
21
11
36
1.90
23278145--23278338
98
2.0
98
84
6
259
30
23
10
35
1.89
23278717--23279075
133
2.7
134
84
4
474
31
18
12
37
1.88
23280056--23280093
20
1.9
20
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0
58
31
5
0
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1.17
23280388--23280420
16
2.1
16
94
0
57
60
0
0
39
0.97
23281380--23281438
31
1.9
31
86
6
84
55
13
11
18
1.68
23285434--23285582
39
3.8
39
88
2
203
30
16
4
48
1.67
23286793--23286878
45
1.9
45
90
4
138
25
31
13
29
1.94
23287092--23287525
210
2.1
209
90
2
683
29
22
19
28
1.98
23287419--23287716
92
3.3
92
65
15
242
29
23
18
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23287518--23288529
210
4.8
210
91
3
1623
30
22
18
29
1.97
23296402--23296432
15
2.1
15
100
0
62
6
38
0
54
1.26
23296476--23296525
15
3.5
14
79
15
50
42
8
24
26
1.82
23297776--23297859
26
3.2
26
96
0
150
34
4
23
36
1.76
23299339--23299390
25
2.0
26
85
3
70
38
23
13
25
1.91
23303503--23303585
26
3.2
26
94
1
141
34
4
22
37
1.76
23306000--23306171
93
1.8
93
90
2
274
29
29
20
21
1.98
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3.7
47
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29
19
20
1.97
23306044--23306187
46
3.1
44
72
15
114
29
28
19
22
1.98
23312498--23312624
39
3.3
39
90
3
186
33
14
4
48
1.64

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378