Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  310  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94204093--94204220
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39
89
0
247
23
31
21
23
1.98
94215447--94215599
39
3.9
39
92
0
252
23
32
20
23
1.98
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39
4.6
39
89
0
247
23
31
21
23
1.98
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3.9
39
92
0
252
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1.98
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2.6
27
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4
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18
22
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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2.2
21
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32
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1.93
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94302001--94302256
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25
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2.1
16
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21
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21
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7.4
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20
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109
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37
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5.5
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16
57
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1.9
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2.0
30
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2.0
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2.5
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11
41
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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121
37
12
6
43
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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395
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27
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1.96
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4.9
49
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301
28
27
17
25
1.98
94436661--94436720
30
2.0
30
83
6
77
30
25
8
36
1.85
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21
1.9
21
84
0
53
37
0
10
52
1.35
94444214--94444365
52
2.9
52
83
4
189
26
17
26
30
1.97
94449756--94450010
55
4.8
54
78
9
251
36
17
25
21
1.95
94449763--94449963
108
1.8
110
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300
34
17
25
22
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16
1.9
16
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0
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0
22
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1.54
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2.3
22
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10
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20
32
1.70
94454512--94454706
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11
197
24
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27
29
1.98
94456751--94456789
19
2.1
19
85
0
51
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5
15
1.26
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2.1
56
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1.96
94457253--94457342
27
3.2
27
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101
32
24
24
18
1.97
94457448--94457512
28
2.3
28
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0
103
30
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27
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2.6
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45
0
45
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1.35
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19
2.1
19
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1.26
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1.96
94465076--94465165
27
3.2
27
81
7
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32
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24
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28
2.3
28
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0
103
30
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27
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1.88
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13
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45
0
45
9
1.35
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21
1.9
21
89
0
62
35
0
10
55
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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10
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5
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43
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41
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23
16
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1.96
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19
2.1
19
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0
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30
12
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40
2.8
40
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0
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20
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2.2
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24
19
24
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1.98
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2.1
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0
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0
0
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29
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75
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2.0
26
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94523609--94523716
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2.0
54
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2.0
17
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0
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27
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24
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0
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0
0
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2.3
17
100
0
78
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12
5
20
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94554356--94554410
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2.6
21
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0
5
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13
2.1
14
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6
51
0
55
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1.42
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17
2.6
17
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2.0
49
100
0
200
50
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19
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0
0
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126
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0
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22
26
2.00
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4.5
40
83
4
191
25
27
20
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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