Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  197  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58047338--58047542
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58047308--58047542
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28
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19
2.2
20
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4
52
34
25
18
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.9
19
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28
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58164750--58165124
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91
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542
32
25
5
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1.78
58164753--58165124
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2.5
148
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23
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0
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18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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26
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1.99
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245
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26
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
58254164--58254230
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44
1.33
58256270--58256311
18
2.3
18
100
0
84
9
0
35
54
1.33
58256254--58256286
11
2.8
12
86
13
50
15
0
36
48
1.45
58259389--58259575
39
4.8
40
87
0
173
24
30
20
24
1.99
58259424--58259586
39
4.2
39
90
0
227
24
31
19
24
1.98
58270482--58270527
24
1.9
24
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0
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54
2
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30
1.50
58270497--58270563
18
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18
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1
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1.56
58270886--58270934
23
2.1
23
88
0
71
65
4
6
24
1.33
58271071--58271106
14
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14
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0
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0
44
1.33
58272020--58272062
2
21.5
2
100
0
86
48
0
0
51
1.00
58272636--58272668
11
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13
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13
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21
0
30
48
1.50
58272652--58272693
18
2.3
18
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0
75
11
0
33
54
1.37
58275386--58275516
52
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13
144
33
15
12
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1.84
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28
2.6
28
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12
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1.60
58295733--58296031
3
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3
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1
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1.29
58297232--58297534
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45
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202
26
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20
36
1.93
58297346--58297626
96
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96
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2
323
27
17
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1.94
58297551--58297886
143
2.3
143
88
1
476
27
21
19
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1.97
58297573--58297956
143
2.7
142
86
2
475
29
20
19
30
1.97
58306056--58306098
19
2.3
19
84
8
52
39
11
20
27
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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3
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3
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59
0
7
32
1.31
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2.1
90
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4
230
37
16
8
36
1.80
58313458--58313543
10
9.4
9
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16
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1
2
32
1.14
58313465--58313537
28
2.6
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1
1
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1.12
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0
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1.25
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2
20.5
2
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0
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0
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1.9
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203
27
20
25
26
1.99
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2.3
23
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1
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1.22
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20
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20
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4
0
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1.19
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1.9
20
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1.08
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21
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1.84
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2.2
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20
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2.1
12
100
0
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2.5
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19
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18
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0
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1.78
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20
2.4
22
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49
0
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1.12
58346072--58346126
24
2.3
23
81
9
58
49
0
1
49
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58346096--58346152
27
2.1
27
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50
1
1
45
1.22
58346282--58346348
20
3.5
20
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17
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37
4
0
58
1.19
58346578--58346619
18
2.5
17
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7
50
50
0
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2.9
14
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76
0
7
15
0.99
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18
2.8
18
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74
3
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11
1.19
58346726--58346758
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0
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0
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0
0
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1.8
106
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3
244
46
18
7
27
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378