Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  365  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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Period
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Copy
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2
60
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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0.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
96
24
14
14
46
1.82
109567780--109567825
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2.1
22
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0
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10
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20
2.3
19
84
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52
4
9
20
65
1.38
109572388--109572464
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5.1
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1
3
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109572434--109572467
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0
0
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0.87
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2.0
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109575542--109575661
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2
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109579794--109579847
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29
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1.77
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231
2.9
227
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792
29
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1.77
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5
0
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1.9
77
85
1
206
52
8
10
29
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
31
83
10
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22
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22
44
1.85
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2.0
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1.43
109641842--109641932
30
3.1
30
77
16
100
58
6
2
32
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109641853--109641909
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2.9
19
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59
3
0
36
1.14
109641823--109641909
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2.1
41
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2
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2.0
27
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0
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3.5
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18
47
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378