Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  342  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Score
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Period
Size
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Number
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Score
A
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(0-2)
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61
1.17
103509462--103509503
19
2.3
18
84
8
57
23
0
4
71
1.05
103512652--103512689
19
2.1
19
85
9
53
55
2
2
39
1.28
103515079--103515103
11
2.3
11
100
0
50
68
8
16
8
1.38
103517442--103517671
46
5.0
46
90
1
309
22
23
13
40
1.89
103519090--103519122
11
3.1
11
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8
50
9
30
0
60
1.27
103520744--103520776
13
2.5
13
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0
57
42
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21
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103520849--103520918
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25
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0
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25
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103525339--103525399
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75
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1
16
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26
26
1.99
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5.3
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4
121
27
20
25
26
1.99
103540083--103540310
80
2.9
79
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241
28
20
25
26
1.99
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120
1.9
120
80
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269
26
20
26
26
1.99
103548172--103548367
40
4.9
40
91
3
281
27
20
25
26
1.99
103548206--103548428
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28
20
25
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1.99
103552096--103552125
15
2.1
15
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6
53
56
0
36
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1.26
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205
4.9
205
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18
23
29
1.98
103561077--103561162
44
2.0
43
88
6
129
31
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26
25
1.96
103561583--103561630
24
2.1
23
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20
35
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103561591--103561640
24
2.1
24
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0
82
28
4
24
44
1.72
103561583--103561640
24
2.6
21
77
15
62
34
3
24
37
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103562113--103562149
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5
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0
0
64
0.94
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3
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0
0
66
0.92
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15
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30
6
0
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1.21
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16
2.0
16
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0
55
21
21
6
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1.71
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2.6
13
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65
1.31
103562663--103562700
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13
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11
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31
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0
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1.17
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22
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19
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5
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0
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0
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0
0
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1.9
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25
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48
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1.99
103583273--103583500
96
2.4
95
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261
25
21
25
27
1.99
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21
2.0
21
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20
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40
12
1.88
103587739--103587951
46
4.5
47
80
4
198
23
27
18
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103587739--103587904
48
3.5
46
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172
24
28
19
27
1.98
103587739--103587951
94
2.3
93
79
4
232
23
27
18
30
1.98
103592700--103592891
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2.0
96
97
0
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1.79
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2
96
0
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0
0
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0
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0
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3.0
52
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7
206
33
23
9
32
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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