Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
3.1
14
76
20
52
17
36
0
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1.48
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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29
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20
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3.0
30
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1.68
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5.2
15
75
9
70
55
15
17
11
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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28
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1.98
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17
18
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2842029--2842223
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3.6
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28
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109
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0
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0
0
50
1.00
2843683--2843760
26
3.1
26
70
25
69
33
5
7
53
1.51
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19
2.8
19
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1
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52
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26
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26
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27
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13
2.1
13
100
0
54
29
7
18
44
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17
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9
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11
2
5
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0.98
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12
3.7
12
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0
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0
20
15
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2.0
77
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0
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18
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17
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17
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3
1
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0
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22
21
20
1.96
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221
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219
91
2
944
33
20
21
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
2
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0
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58
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0
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46
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21
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28
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2948594--2948764
93
1.8
93
94
0
306
20
22
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2951405--2951493
48
2.0
43
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124
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3
3
70
1.17
2951433--2951510
6
12.7
6
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10
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19
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1.02
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29
2.0
30
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25
10
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1.44
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42
2.5
43
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22
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2.0
44
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2.1
14
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0
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0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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