Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1402670--1402712
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0
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7
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25
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26
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.7
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62
40
7
14
37
1.75
1567203--1567249
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3.2
15
87
3
60
46
6
12
34
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
13
21
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1680920--1681564
150
4.2
156
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8
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15
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95
4
53
83
0
6
10
0.81
1692177--1692240
31
2.1
31
88
2
94
25
4
10
59
1.50
1693355--1693413
30
2.0
29
87
6
84
54
3
16
25
1.58
1700407--1700477
30
2.3
29
80
9
79
64
4
2
28
1.26
1702376--1702922
240
2.3
239
88
2
783
31
17
14
37
1.89
1710088--1710374
137
2.1
137
95
1
513
32
25
18
24
1.97
1712161--1712270
26
4.2
26
89
0
175
37
23
5
33
1.78
1721610--1721652
21
2.0
21
82
8
52
34
2
11
51
1.51
1730962--1731010
23
2.1
23
88
11
73
24
4
0
71
1.03
1734541--1734608
30
2.3
29
82
7
75
55
7
10
26
1.59
1735756--1735782
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
1737505--1737535
13
2.4
13
94
0
53
35
9
25
29
1.88
1738222--1738266
21
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19
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7
63
15
8
11
64
1.49
1740482--1740551
30
2.3
29
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9
68
48
4
10
37
1.56
1751010--1751047
15
2.5
16
83
12
53
55
0
0
44
0.99
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2.0
61
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7
144
52
0
1
45
1.16
1751767--1751828
32
2.0
31
84
6
81
43
0
3
53
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1752238--1752280
22
2.0
22
82
13
54
60
0
0
39
0.97
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25
2.6
23
81
18
74
49
0
0
50
1.00
1757438--1757484
19
2.5
20
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19
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8
8
27
55
1.59
1760109--1760181
30
2.4
30
80
13
78
38
13
2
45
1.58
1761739--1761777
17
2.1
20
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13
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53
0
7
38
1.30
1763722--1763769
24
2.0
24
95
0
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58
12
14
14
1.64
1763993--1764050
23
2.5
23
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18
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43
6
1
48
1.40
1766093--1766160
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3.0
23
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1
0
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1.09
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2.6
22
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1
0
43
1.10
1768854--1768882
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4
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7
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75
0
0
24
0.80
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1.9
25
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12
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73
2
2
22
1.04
1780751--1780821
31
2.3
31
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0
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28
8
15
47
1.74
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23
1.9
23
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0
79
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6
22
1.61
1781968--1782033
29
2.2
30
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2
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40
16
7
34
1.77
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5.2
5
100
0
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0
0
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2.6
31
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28
11
4
55
1.55
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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2
20.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
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2.0
41
100
0
164
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7
17
48
1.73
1796748--1796777
2
15.5
2
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53
50
0
0
50
1.00
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20
2.0
20
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10
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56
5
2
35
1.35
1807845--1807920
29
2.5
30
82
4
82
39
6
19
34
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1809502--1810222
318
2.3
317
81
5
827
38
20
13
27
1.90
1812573--1812632
30
2.0
30
83
6
77
53
3
13
30
1.56
1814284--1814322
19
2.0
20
85
5
53
10
17
2
69
1.28
1814311--1814360
20
2.5
20
76
3
55
8
16
2
74
1.15
1817918--1817944
4
6.8
4
100
0
54
51
22
0
25
1.48
1820859--1820899
3
13.7
3
94
0
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29
0
34
36
1.58
1832612--1832642
15
2.1
15
100
0
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25
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1834284--1834320
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2.3
17
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0
0
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31
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0
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3.6
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100
0
58
0
10
0
89
0.48

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378