Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  344  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.66
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
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Score
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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10
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52
2
7
37
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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47
27
1.72
103944669--103944911
88
2.8
85
79
11
233
35
18
16
30
1.92
103944853--103945444
77
7.8
76
80
12
626
33
20
16
29
1.95
103944828--103945446
151
4.1
151
80
11
694
33
20
16
29
1.94
103944853--103945275
229
1.9
223
89
4
661
32
22
17
27
1.96
103945286--103945422
70
2.0
70
91
2
222
31
18
14
35
1.92
103945160--103945510
158
2.2
154
83
8
399
34
19
15
30
1.93
103945381--103945598
88
2.5
88
95
0
391
35
18
15
30
1.92
103945666--103946009
77
4.4
76
81
9
351
32
20
15
31
1.94
103945948--103946207
99
2.6
99
95
0
457
37
19
18
25
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103946132--103946300
86
2.0
87
90
1
268
37
20
17
24
1.94
103946224--103946388
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2.2
74
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1
251
34
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17
26
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159
2.1
163
83
3
436
35
20
17
26
1.95
103956425--103956459
16
2.3
15
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5
52
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2
2
31
1.24
103956574--103956633
23
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20
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5
6
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1.47
103956611--103956681
25
3.0
23
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5
30
1.45
103956704--103956820
25
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5
37
1.43
103957318--103957414
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3.2
30
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0
149
18
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103957753--103957800
3
16.0
3
100
0
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0
0
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2
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32
10
14
43
1.79
103965315--103965368
24
2.3
24
81
12
67
35
24
0
40
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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40
0
0
60
0.97
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22
2.6
22
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5
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0
0
48
1.00
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2.1
16
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0
3
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1.16
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24
2.1
24
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0
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1.76
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31
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3
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4
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20
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0
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0
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0
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1.64
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33
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0
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13
2.0
13
100
0
52
38
7
7
46
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104020099--104020190
33
2.8
33
82
8
116
32
22
10
33
1.89
104020893--104020940
21
2.2
22
82
14
64
35
16
0
47
1.47
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2.0
137
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0
500
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25
1.97
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26
3.2
26
96
0
150
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4
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2.3
43
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2.6
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2
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0
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0
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0
0
51
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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