Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  3  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
832628--832669
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0
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135
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126
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11
18
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1.86
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2.0
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2
4
1.17
877460--877535
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4.4
17
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15
57
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18
5
3
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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70
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5
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2
24.0
2
86
0
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2
4
47
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878285--878326
13
3.3
13
83
3
50
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0
7
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1.20
878310--878338
15
2.0
15
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6
51
27
0
6
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1.18
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2.6
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20
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32
4
4
57
1.41
879490--879533
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14
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9
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0
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36
2.0
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0
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45
5
16
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1.70
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2.2
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13
29
40
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30
2.2
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2.1
30
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3
88
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21
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28
0
10
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30
2.4
31
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78
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5
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10
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0
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2
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1.28
903130--903215
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2.1
41
95
2
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1
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2.7
18
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2
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1.05
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0
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1.9
13
100
0
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20
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924313--924424
27
4.2
26
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5
125
35
21
24
18
1.95
924313--924424
54
2.1
54
84
3
145
35
21
24
18
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
924817--924846
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0
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26
26
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100
0
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0
0
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0
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4.2
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22
23
18
1.96
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54
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22
23
18
1.95
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5.2
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2
223
36
24
4
34
1.76
942551--942676
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5.1
22
92
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108
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25
3
33
1.75
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27
4.3
26
85
5
138
35
22
23
17
1.95
946626--946739
54
2.1
53
86
1
156
35
22
23
17
1.95
946626--946737
26
4.2
26
81
5
125
35
22
24
17
1.95
948353--948462
26
4.2
26
95
2
177
36
24
4
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1.76
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3.1
31
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1.95
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29
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5
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40
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0
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1.31
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1.9
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2.0
26
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15
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1.92
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2.3
30
84
5
84
27
17
5
48
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
988109--988142
3
11.3
3
100
0
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0
0
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0.91
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1.9
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8
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2
18
2
0.95
995105--995144
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2.2
18
86
0
53
32
2
12
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1.52
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3.9
39
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0
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29
21
25
1.99
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0
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1.99
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1.9
78
94
0
266
26
19
25
27
1.99
1006471--1006504
12
2.8
12
90
0
50
17
26
14
41
1.88
1006612--1006655
18
2.4
18
88
0
61
34
13
13
38
1.84
1008711--1008861
78
1.9
78
95
0
275
25
19
26
27
1.99
1011277--1011310
12
2.8
12
90
0
50
17
26
14
41
1.88
1011418--1011461
18
2.4
18
88
0
61
34
13
13
38
1.84
1013517--1013667
78
1.9
78
95
0
275
25
19
26
27
1.99
1017173--1017220
24
2.0
24
84
8
62
52
12
0
35
1.40
1017860--1017892
17
2.0
16
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5
57
66
0
3
30
1.06
1017921--1017959
19
2.1
19
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9
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51
10
5
33
1.58
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4
7.5
4
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0
60
76
0
23
0
0.78
1021375--1021525
78
1.9
78
95
0
275
25
19
26
27
1.99
1025026--1025073
24
2.0
24
84
8
62
52
12
0
35
1.40
1025713--1025745
17
2.0
16
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5
57
66
0
3
30
1.06
1025774--1025812
19
2.1
19
85
9
53
51
10
5
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1026984--1027009
6
4.3
6
100
0
52
15
15
15
53
1.73
1026939--1027069
57
2.2
59
84
6
160
19
22
16
41
1.90
1029261--1029411
78
1.9
78
95
0
275
25
19
26
27
1.99
1032074--1032183
26
4.2
26
94
4
177
34
5
23
36
1.78
1035270--1035502
27
8.6
27
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1
297
40
21
7
30
1.81
1035498--1035716
27
8.2
27
92
1
343
29
23
7
39
1.81
1035471--1035716
80
3.1
81
85
1
307
30
23
7
38
1.83
1035953--1036003
27
1.9
26
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17
27
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35
1.94
1036221--1036318
31
3.2
31
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20
17
14
47
1.82
1036221--1036354
6
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6
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112
19
18
13
48
1.81
1036243--1036354
49
2.3
49
92
0
179
18
20
13
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1.82
1038454--1038507
26
2.1
27
82
6
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24
14
24
37
1.93
1046836--1046883
24
2.0
24
84
8
62
52
12
0
35
1.40
1047580--1047618
19
2.1
19
85
9
53
51
10
5
33
1.58
1048972--1049015
18
2.4
18
80
0
52
29
13
15
40
1.86
1049947--1050009
28
2.2
28
88
2
90
46
23
9
20
1.80
1051081--1051231
78
1.9
78
95
0
275
25
19
26
27
1.99
1054881--1054988
26
4.2
26
91
0
180
32
8
24
35
1.85
1056465--1056517
26
2.0
26
82
7
63
39
20
15
24
1.91
1058531--1058563
17
2.0
16
94
5
57
66
0
3
30
1.06
1058592--1058630
19
2.1
19
85
9
53
51
10
5
33
1.58
1059985--1060029
18
2.5
17
86
10
63
31
15
17
35
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1060676--1060715
21
2.0
20
85
5
53
42
2
17
37
1.63
1064624--1064731
26
4.2
26
86
0
153
30
10
25
34
1.89
1065023--1065047
10
2.5
10
100
0
50
60
0
12
28
1.32
1065422--1065474
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2.0
25
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13
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35
22
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1.93
1065721--1066006
137
2.1
136
96
0
527
24
18
24
31
1.98
1070695--1070726
16
2.0
16
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0
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0
28
0
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0
27
3
68
1.06
1070759--1070801
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2.3
19
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11
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0
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1.12
1073700--1073850
78
1.9
78
95
0
275
26
19
26
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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