Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  30  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7280963--7280987
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0
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20
2.9
20
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40
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0
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1.32
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23
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1.99
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127
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454
29
22
24
24
1.99
7324437--7324917
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2.3
215
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24
24
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2.2
45
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0
119
32
17
24
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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18
1.93
7327169--7327278
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2.1
52
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148
39
20
21
18
1.93
7327176--7327296
54
2.2
54
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22
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1.92
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22
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22
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23
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2.3
81
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200
33
8
20
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0
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1.79
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2.0
61
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215
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1.79
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2.0
35
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2.3
26
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23
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24
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23
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3.5
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23
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2.0
15
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0
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16
40
20
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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27
1.97
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2.3
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192
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27
1.97
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2.3
58
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174
29
16
26
28
1.97
7353557--7353687
29
4.6
28
89
3
172
29
16
26
28
1.97
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16
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27
1.97
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40
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1
348
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29
23
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1.99
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24
29
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25
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18
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24
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11
254
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5
22
36
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7381606--7381747
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18
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32
3.2
32
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102
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1
16
24
1.45
7389911--7390032
58
2.1
58
98
1
237
58
1
16
23
1.47
7391107--7391139
13
2.7
13
90
9
52
84
0
15
0
0.61
7391106--7391167
11
5.3
11
76
14
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80
1
16
1
0.87
7391107--7391150
19
2.2
21
88
8
65
84
2
13
0
0.73
7391110--7391167
24
2.5
22
78
13
53
79
1
17
1
0.90
7394086--7394167
26
3.1
27
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19
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39
2
8
50
1.46
7394084--7394187
52
2.0
52
96
0
190
37
1
10
50
1.48
7394493--7394525
2
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2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
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20
2.0
19
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5
60
61
0
2
35
1.10
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20
2.0
20
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0
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2
0
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1.08
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2.0
20
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56
0
7
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1.27
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33
2.0
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0
134
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26
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26
95
0
279
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1.79
7407766--7407927
78
2.1
78
98
0
315
33
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1.79
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18
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18
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18
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10
6
0
82
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14
5.2
13
80
11
54
9
7
0
83
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.4
17
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15
5
0
80
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24
3.1
25
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0
2
56
1.14
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22
3.1
22
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14
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44
0
4
51
1.20
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24
3.2
22
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19
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42
0
4
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1.20
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0
3
56
1.17
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47
2.1
47
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0
3
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1.15
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22
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56
3
1
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2.0
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3
0
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1.24
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22
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20
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4
0
42
1.20
7416639--7416707
21
3.2
21
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10
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53
4
0
42
1.20
7416645--7416734
42
2.1
42
78
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57
2
1
38
1.18
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10
3.7
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11
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0
0
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15
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6
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1.53
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12
100
0
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38
0
0
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0
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0
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10
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0
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18
2.3
18
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2
0
50
1.14
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20
2.2
20
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0
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1.37
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29
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70
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1
5
28
1.23
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100
0
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0
0
50
1.00
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2
100
0
68
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0
0
50
1.00
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2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7439343--7439451
56
1.9
56
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0
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8
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48
100
0
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2
15.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
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3.7
38
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202
21
22
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18
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0
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10
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2.7
37
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0
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25
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29
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23
2.3
23
93
0
86
34
0
13
51
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378