Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  73  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19309499--19309547
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0
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20
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16
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0
0
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
1.95
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11.0
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18
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234
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19
33
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1.9
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431
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19
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72
16
211
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5
3
59
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
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20
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12
26
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19514761--19514801
15
2.5
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0
0
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20
21
25
1.97
19521339--19521447
26
4.2
26
95
1
193
33
4
23
37
1.76
19523230--19523515
136
2.1
137
97
0
538
24
18
24
31
1.98
19527281--19527390
26
4.2
26
96
0
193
33
4
24
37
1.76
19529165--19529450
136
2.1
137
97
0
538
24
18
24
31
1.98
19531557--19531625
30
2.3
30
82
0
84
20
36
17
26
1.94
19532542--19532645
41
2.6
41
83
4
122
32
23
15
28
1.95
19533454--19533492
20
2.0
19
85
5
51
0
25
0
74
0.82
19539805--19539943
40
3.5
40
75
8
106
29
22
19
28
1.98
19544925--19545157
22
10.6
21
65
18
77
34
3
3
58
1.31
19544936--19545027
17
5.3
16
71
22
53
33
1
1
64
1.08
19544905--19544969
22
3.2
20
79
12
69
27
4
4
63
1.34
19544926--19545014
31
2.8
31
76
20
87
32
2
1
64
1.13
19544933--19545044
37
3.1
37
75
14
101
33
1
1
63
1.15
19544932--19545036
15
7.4
14
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60
34
1
0
62
1.12
19545186--19545245
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2.7
22
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7
77
31
6
0
61
1.22
19545217--19545243
14
1.9
14
100
0
54
37
3
0
59
1.15
19545224--19545275
17
3.1
17
77
22
65
32
3
1
61
1.25
19545209--19545275
34
2.0
33
88
2
98
34
2
1
61
1.20
19545210--19545261
14
3.7
13
75
25
52
34
1
1
61
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19547982--19548034
26
2.0
26
82
7
63
26
15
20
37
1.92
19549520--19549603
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
19560348--19561059
289
2.5
288
87
1
1012
32
17
20
29
1.96
19562898--19563077
22
8.1
21
67
20
91
33
3
2
60
1.27
19562898--19563009
32
3.4
32
78
19
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33
2
0
62
1.15
19562878--19562942
22
3.2
20
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12
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27
4
4
63
1.34
19562906--19563007
15
7.0
15
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20
74
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1
0
62
1.13
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20
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23
66
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2
2
59
1.27
19563159--19563218
23
2.7
22
84
7
77
31
6
0
61
1.22
19563190--19563216
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1.9
14
100
0
54
37
3
0
59
1.15
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17
4.0
17
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2
1
61
1.20
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34
2.4
33
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2
104
35
2
1
60
1.18
19563183--19563234
14
3.7
13
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34
1
1
61
1.18
19569475--19570087
306
2.0
306
96
0
1136
31
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15
24
1.96
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19
2.0
20
90
5
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20
0
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1.10
19572408--19572454
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2.0
25
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31
0
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1.21
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2.3
21
96
0
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22
18
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25
2.0
25
87
0
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14
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28
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
19583132--19583177
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2.1
23
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60
52
4
10
32
1.56
19595652--19595703
27
1.9
27
100
0
104
28
0
25
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19598059--19598096
13
2.8
13
85
14
51
44
18
5
31
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19602379--19602474
42
2.3
42
79
0
111
19
35
17
27
1.95
19603194--19603246
26
2.0
27
85
10
74
71
1
18
7
1.19
19603197--19603261
26
2.6
25
80
11
62
72
1
21
4
1.11
19606538--19606567
16
1.9
16
93
6
53
23
40
0
36
1.55
19607557--19607585
15
1.9
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100
0
58
48
6
6
37
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12
52
88
11
0
0
0.51
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2.0
17
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5
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0
0
0.59
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0
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0
0
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0.37
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31
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41
15
9
33
1.79
19638380--19638419
21
1.9
21
85
10
55
32
5
7
55
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378