Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  267  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80148493--80148732
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0
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0
0
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19
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2.4
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11
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54
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2
34
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.0
10
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4
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43
1.87
80226660--80226713
21
2.7
20
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22
20
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2.0
25
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35
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80248275--80248323
24
2.0
24
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27
27
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172
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1094
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17
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1.96
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2.0
19
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31
23
10
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1.89
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1.94
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4.8
31
83
3
183
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19
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.65
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0
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2.0
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40
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19
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2
27
44
1.66
80323870--80323955
31
2.9
31
77
10
81
22
0
39
38
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80323902--80323959
14
4.1
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20
0
44
34
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2.3
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0
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22
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25
29
1.99
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85
3.1
85
86
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21
25
29
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20.3
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0
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0
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19
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Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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2
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.00

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