Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  119  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
256
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.93
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Period
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Percent
Matches
Percent
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Score
A
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(0-2)
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27
25
2.00
33503176--33503363
94
2.0
94
97
0
358
41
14
13
29
1.85
33509166--33509333
46
3.6
46
76
16
175
27
30
20
20
1.98
33509166--33509352
46
4.0
46
70
16
127
28
30
20
20
1.98
33511624--33511692
30
2.3
30
85
7
97
59
17
14
8
1.60
33511624--33511692
15
4.7
15
80
8
79
59
17
14
8
1.60
33514638--33514810
93
1.9
93
93
0
301
27
31
21
20
1.98
33514631--33514806
46
3.8
46
78
10
196
28
30
21
19
1.98
33514639--33514825
46
4.0
46
73
14
143
28
30
20
20
1.98
33519445--33519689
40
6.2
40
91
3
329
24
22
27
26
1.99
33521343--33521384
21
2.0
21
90
0
66
52
23
7
16
1.68
33523150--33523186
19
1.9
19
89
10
58
27
18
5
48
1.70
33526649--33526721
27
2.7
27
80
4
85
26
26
12
35
1.91
33530100--33530319
46
4.6
49
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11
180
25
18
30
25
1.98
33533557--33533865
46
6.6
47
79
8
280
27
19
28
24
1.99
33533557--33533865
91
3.3
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12
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27
19
28
24
1.99
33533651--33533873
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2.4
95
83
10
262
25
19
30
25
1.98
33537039--33537165
47
2.7
47
91
0
209
29
30
18
20
1.97
33539714--33539921
40
5.2
40
85
3
240
25
22
27
24
2.00
33541940--33542040
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33549893--33549993
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
33553476--33553576
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
33561568--33561698
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
33561567--33561698
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
33569511--33569611
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
33578470--33578571
40
2.6
40
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3
118
29
20
27
22
1.99
33578539--33578603
31
2.1
32
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2
114
24
23
32
20
1.98
33578508--33578643
71
1.9
72
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4
186
25
22
29
22
1.99
33578579--33578667
40
2.2
40
88
4
135
23
23
26
25
2.00
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2.0
50
89
2
153
29
7
9
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1.59
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11
2.8
12
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0
0
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0.93
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30
2.1
30
100
0
126
57
11
3
28
1.49
33589013--33589052
21
2.0
21
90
5
64
37
27
25
10
1.88
33590546--33590617
6
11.8
6
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14
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48
13
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18
1.81
33590735--33590800
27
2.5
26
83
11
80
37
22
21
18
1.94
33590759--33590816
27
2.1
27
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6
64
36
27
18
17
1.94
33590973--33591031
22
2.7
22
78
0
64
35
22
22
20
1.96
33591122--33591201
27
3.0
26
90
3
115
35
21
23
20
1.96
33591400--33591585
27
7.0
27
83
2
223
25
20
18
36
1.95
33591400--33591593
53
3.6
53
83
3
237
25
19
18
36
1.94
33591509--33591621
53
2.1
53
80
6
122
30
15
16
37
1.91
33591602--33592088
27
18.0
27
84
3
613
39
9
23
27
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
33598845--33598906
29
2.2
27
85
5
79
20
22
24
32
1.98
33603837--33604004
40
4.2
40
83
5
198
26
29
22
22
1.99
33603853--33604001
80
1.9
80
88
5
230
24
28
23
22
1.99
33611540--33611707
40
4.2
40
85
5
207
26
28
22
23
1.99
33611540--33611707
80
2.1
80
87
4
241
26
28
22
23
1.99
33619547--33619676
43
3.0
42
78
7
145
32
25
14
27
1.95
33621392--33621434
21
2.1
20
83
12
52
20
0
41
37
1.53
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27
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0
278
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1.92
33622900--33623135
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2.9
81
83
5
228
31
16
18
33
1.93
33623095--33623162
27
2.5
27
85
0
82
41
16
22
20
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378