Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  230  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68009101--68009127
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0
0
0.00
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2
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22.4
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21
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1
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2.8
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5.4
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1.25
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2.8
12
91
4
52
57
0
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34
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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30
1.16
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65
0
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1.11
68069889--68069991
19
5.5
18
73
16
77
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0
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30
1.10
68069742--68070009
17
15.9
16
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20
95
62
1
4
30
1.25
68069928--68070021
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1
2
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1.10
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1.9
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63
69
0
4
25
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4.3
22
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5
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28
12
23
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2
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56
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13
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28
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90
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10
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12
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165
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1.98
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1.8
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2
274
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20
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28
1.99
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28
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1.88
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150
22
21
26
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1.99
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154
26
32
15
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1.96
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29
3.6
29
92
2
154
26
32
15
26
1.96
68112177--68112226
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6
84
2
64
28
0
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68
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4.7
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38
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10.9
27
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2
135
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22
7
33
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
54
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36
1.82
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3.3
81
77
2
223
35
22
7
33
1.83
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27
6.6
27
86
2
232
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20
9
29
1.84
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54
4.4
54
82
4
201
39
21
10
28
1.86
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81
2.9
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221
39
21
10
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1.87
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5.0
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164
33
20
22
23
1.97
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2.5
54
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0
182
33
20
22
23
1.97
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25
2.6
25
97
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121
26
27
24
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1.99
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31
2.7
31
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152
28
16
26
28
1.97
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20
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1.98
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19
12
25
1.85
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3.5
53
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19
11
26
1.84
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2.3
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1
221
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19
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1.81
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180
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14
26
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1.95
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1.97
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30
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1.99
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0
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51
0
0
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1.00
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5
203
30
25
16
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68187700--68187884
101
1.8
99
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246
30
25
16
27
1.97
68189683--68189849
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
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80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
68190674--68190719
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
68197684--68197850
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
68197684--68197850
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
68198675--68198720
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
68205903--68206017
47
2.5
48
85
7
148
27
17
31
23
1.97
68213272--68213405
43
3.2
42
77
7
137
27
15
26
30
1.96
68213288--68213409
41
2.9
43
83
4
158
25
17
27
30
1.97
68213401--68213425
12
2.1
12
100
0
50
32
24
16
28
1.96
68213608--68213645
18
2.1
19
90
5
60
50
0
15
34
1.45
68217878--68217928
21
2.4
21
86
0
75
43
17
19
19
1.89
68229987--68230159
93
1.9
93
90
2
276
28
29
19
21
1.98
68229980--68230151
46
3.7
45
74
9
159
30
29
18
22
1.97
68243990--68244063
25
2.9
26
75
13
82
27
25
18
28
1.98
68265140--68265309
45
3.7
46
76
14
188
22
18
28
30
1.97
68268005--68268086
41
2.0
41
100
0
164
26
14
26
31
1.95
68271605--68271669
27
2.4
26
80
7
76
41
15
15
27
1.87
68271816--68271872
27
2.1
27
83
0
69
15
21
22
40
1.91
68278142--68278436
143
2.1
141
97
1
554
21
10
28
38
1.87
68279081--68279211
29
4.5
29
89
0
163
29
16
31
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68281626--68281748
61
2.0
61
100
0
246
31
19
19
29
1.96
68288183--68288276
42
2.2
42
81
9
102
31
23
19
25
1.98
68289253--68289289
18
2.1
18
100
0
74
32
21
10
35
1.88
68293733--68293778
20
2.3
20
82
14
60
28
23
17
30
1.97
68296212--68296237
3
8.7
3
100
0
52
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0
0
30
0.89
68300718--68300782
28
2.3
28
92
5
105
33
29
7
29
1.85
68300889--68300975
28
3.1
27
81
5
93
20
21
22
34
1.97
68300889--68300975
27
3.1
28
81
5
95
20
21
22
34
1.97
68306593--68306800
40
5.2
40
80
2
193
25
25
24
25
2.00
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28
2.3
28
92
5
105
33
29
7
29
1.85
68312004--68312091
26
3.2
28
79
12
103
20
22
23
32
1.98
68312016--68312102
27
3.1
28
81
6
88
22
25
19
32
1.98
68315549--68315732
40
4.6
40
83
6
230
25
22
26
26
2.00
68315549--68315768
80
2.8
78
84
5
255
24
22
26
26
2.00
68321274--68321343
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
68325179--68325340
39
4.2
39
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2
254
24
32
19
23
1.98
68325179--68325329
77
1.9
79
93
2
261
23
31
20
23
1.98
68332479--68332548
27
2.6
27
93
2
113
30
28
14
27
1.95
68338227--68338410
40
4.6
40
83
6
230
25
23
26
24
2.00
68338227--68338410
80
2.3
80
87
3
255
25
23
26
24
2.00
68342488--68342557
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2.2
32
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0
122
55
0
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35
1.30
68345913--68345963
18
2.8
18
79
8
68
60
0
35
3
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68345913--68345969
18
3.2
18
78
7
62
63
0
33
3
1.12
68348588--68348621
18
1.9
18
88
5
52
29
17
11
41
1.85
68353274--68353321
19
2.6
18
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3
51
37
20
6
35
1.78
68353438--68353518
39
2.1
39
92
0
135
48
8
8
34
1.65
68356200--68356339
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4.0
35
76
10
133
44
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8
27
1.80
68357100--68357165
28
2.3
28
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78
27
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54
1.58
68358527--68358600
27
2.7
28
80
4
96
27
33
14
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1.94
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29
29
20
20
1.98
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1.8
92
96
1
315
28
29
21
21
1.98
68377111--68377281
93
1.8
93
96
0
315
28
29
21
21
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378