Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  259  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Period
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Score
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19
29
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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45
84
4
118
34
26
17
21
1.95
77905199--77905253
25
2.2
26
78
15
62
41
9
0
49
1.34
77906085--77906109
9
2.8
9
100
0
50
52
24
0
24
1.48
77919200--77919247
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
77919295--77919350
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
77919290--77919350
20
3.0
20
95
0
113
34
11
19
34
1.88
77919400--77919542
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
77919400--77919542
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
77919400--77919543
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
77923829--77923870
17
2.4
18
92
4
68
23
16
28
30
1.96
77925910--77925957
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
77926000--77926060
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
77926109--77926272
24
7.0
23
87
8
219
29
21
22
26
1.99
77926109--77926271
47
3.5
47
90
5
235
28
22
22
26
1.99
77931801--77931833
8
4.1
8
100
0
66
12
0
39
48
1.40
77936261--77936442
40
4.6
40
79
8
176
24
24
28
23
2.00
77936261--77936442
78
2.3
80
82
6
210
24
24
28
23
2.00
77944287--77944468
40
4.6
40
79
8
176
24
24
28
23
2.00
77944287--77944468
78
2.3
80
82
6
210
24
24
28
23
2.00
77951100--77951193
46
2.0
46
100
0
188
42
8
17
31
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77953538--77953575
15
2.5
15
91
0
58
36
26
13
23
1.91
77959372--77959440
24
2.7
26
82
8
81
21
23
21
33
1.97
77962713--77962738
6
4.3
6
100
0
52
84
0
0
15
0.62
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39
2.2
39
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2
129
25
30
22
22
1.99
77975761--77975796
18
2.1
18
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5
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19
25
38
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1.92
77978403--77978452
15
3.4
15
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4
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1.36
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13
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1.83
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20
2.4
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1
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1.24
77984857--77984909
21
2.5
21
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49
1
1
47
1.23
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2.2
24
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58
45
0
1
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1.11
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3.1
8
100
0
50
52
0
0
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1.00
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27
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29
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1.95
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29
33
16
21
1.95
78007850--78008030
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3.7
49
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1
236
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1.97
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1.8
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95
0
328
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26
1.97
78009852--78009910
19
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19
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0
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1.97
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3
121
48
4
4
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19
2.0
20
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53
48
0
20
30
1.50
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2.6
27
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2
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31
25
14
28
1.95
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92
1.9
92
95
0
308
27
28
21
22
1.99
78022931--78023105
46
3.8
46
80
11
214
29
28
21
21
1.98
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93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78030474--78030649
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
78032055--78032088
18
1.9
18
88
5
52
29
17
11
41
1.85
78033124--78033198
28
2.7
28
85
8
107
29
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12
24
1.91
78033419--78033453
16
2.2
16
89
0
52
14
14
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1.82
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2.1
16
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0
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15
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18
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1.81
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5.7
40
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5
271
25
20
27
26
1.99
78046848--78047070
119
1.9
120
82
8
285
25
20
27
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1.99
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79
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271
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1.99
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117
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1.87
78052906--78052949
23
1.9
23
81
9
54
34
0
27
38
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378