Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  333  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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Period
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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Period
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(0-2)
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178
42
12
2
42
1.56
101269122--101269189
34
2.0
34
100
0
136
23
20
11
44
1.84
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39
3.9
39
92
0
243
23
20
31
24
1.98
101272085--101272266
39
4.6
39
88
0
238
23
21
30
23
1.99
101280113--101280148
18
2.0
18
88
0
54
36
44
5
13
1.68
101280177--101280217
6
6.5
6
83
10
55
78
2
0
19
0.87
101280169--101280212
20
2.1
21
91
4
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70
2
0
27
0.99
101280180--101280218
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20
0.90
101280238--101280305
9
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9
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0
91
25
7
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45
1.77
101286498--101286591
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2.4
40
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3
111
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36
10
14
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101291120--101291188
28
2.5
28
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2
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43
27
10
18
1.82
101293267--101293374
25
4.3
25
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6
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21
28
18
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1.97
101294409--101294482
30
2.5
30
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0
112
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22
32
21
1.98
101295745--101295951
53
3.8
53
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3
198
20
22
18
39
1.93
101298760--101298817
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28
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8
0
53
1.32
101298910--101298976
26
2.6
27
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11
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32
7
1
58
1.35
101302545--101302611
9
7.1
9
77
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28
1
1
68
1.07
101302548--101302651
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3.6
27
75
20
77
33
0
0
64
1.07
101302551--101302613
10
6.8
9
79
12
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28
1
1
68
1.08
101302603--101302638
13
2.8
13
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4
56
44
0
0
55
0.99
101302549--101302662
41
2.8
39
79
10
113
35
0
0
62
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101303102--101303162
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4.7
13
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8
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37
0
19
42
1.52
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3
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3
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0
51
28
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30
1.79
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72
3.3
72
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3
358
54
15
6
23
1.64
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77
2.0
77
94
0
274
29
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1.91
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33
2
0
64
1.08
101315414--101315495
33
2.6
31
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14
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3
17
1.30
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19
1.9
19
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101327813--101327878
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0
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0
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1.52
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2.7
27
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1.40
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27
0
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1.10
101351569--101351611
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20
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1.72
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44
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29
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1.98
101359621--101360096
133
3.6
133
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611
29
18
24
26
1.98
101359625--101360053
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4.8
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225
29
19
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27
1.98
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2
16.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.2
21
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4
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1.38
101361652--101361851
26
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26
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83
29
9
4
57
1.50
101361861--101361914
24
2.2
25
78
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29
1
3
64
1.21
101364299--101364324
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10
100
0
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0
0
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0.39
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3
15.3
3
100
0
92
65
0
0
34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101369052--101369087
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1.9
18
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5
54
41
0
0
58
0.98
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21
2.0
22
82
13
54
55
4
2
37
1.33
101373838--101373888
26
2.0
26
100
0
102
37
15
15
31
1.89
101377431--101377660
49
4.6
49
82
3
289
28
27
18
25
1.98
101377431--101377660
100
2.3
99
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3
336
28
27
18
25
1.98
101380513--101380550
20
1.9
20
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10
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44
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21
21
1.85
101382495--101382706
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4.6
46
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277
40
15
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20
1.91
101382491--101382706
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39
15
24
20
1.91
101382442--101382706
137
2.0
130
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338
38
15
24
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1.92
101385859--101385896
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378