Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  367  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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2.1
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22
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2
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13
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35
0
9
54
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
1.00
110107100--110107175
11
6.6
10
73
20
53
69
2
25
2
1.14
110107100--110107175
25
3.2
24
74
16
63
69
2
25
2
1.14
110108496--110108544
18
2.7
19
78
12
59
36
8
14
40
1.75
110110921--110111071
53
2.8
53
89
4
214
29
27
16
25
1.97
110119437--110119607
75
2.4
75
83
7
203
32
11
23
32
1.91
110119440--110119603
35
4.5
36
85
7
181
32
11
23
32
1.91
110121113--110121263
53
2.8
54
88
6
209
30
27
15
25
1.96
110124094--110124159
28
2.3
28
86
2
87
39
3
9
48
1.50
110126767--110126812
2
23.0
2
95
0
83
47
0
0
52
1.00
110131688--110131731
22
2.0
22
82
8
54
50
2
0
47
1.13
110137689--110137893
101
2.0
102
97
1
385
41
11
11
35
1.77
110138262--110138305
10
4.2
10
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11
52
38
0
4
56
1.20
110140264--110140325
31
2.0
31
100
0
124
41
6
12
38
1.69
110140837--110140936
48
2.1
48
100
0
200
30
19
12
39
1.87
110148504--110148547
21
2.1
21
82
0
52
4
56
11
27
1.53
110149109--110149149
18
2.2
20
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59
43
2
0
53
1.13
110149351--110149439
15
6.1
15
78
19
57
33
1
2
62
1.15
110149398--110149439
3
14.0
3
100
0
84
33
0
0
66
0.92
110149661--110149689
14
2.0
15
93
6
51
55
0
6
37
1.27
110149998--110150032
17
2.1
17
88
0
52
51
8
11
28
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110152635--110152689
22
2.5
22
79
2
58
41
0
27
30
1.56
110154289--110154340
18
2.9
18
91
0
86
36
13
9
40
1.77
110159117--110159170
22
2.4
23
79
11
60
50
1
7
40
1.41
110160311--110160341
6
5.2
6
100
0
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16
0
51
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1.44
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42
2.0
42
100
0
170
42
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31
1.80
110166693--110166725
16
2.1
16
100
0
66
24
6
18
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1.68
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2
16.5
2
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0
57
45
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0
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5.3
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34
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50
12
1.56
110172441--110172476
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1.9
19
88
5
56
36
2
2
58
1.27
110172439--110172486
18
2.7
18
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15
55
37
2
2
58
1.22
110178363--110178424
29
2.1
30
82
8
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4
8
53
1.52
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19
2.3
18
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12
50
48
0
2
48
1.14
110178734--110178797
31
2.1
31
85
5
87
48
3
4
43
1.39
110178787--110178828
19
2.3
18
84
12
50
59
0
2
38
1.10
110191339--110191371
16
2.0
17
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5
59
51
0
0
48
1.00
110193006--110193107
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2.2
47
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3
161
24
14
22
38
1.92
110195638--110195683
2
23.5
2
91
4
76
52
2
0
45
1.13
110196667--110196733
30
2.2
30
76
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40
13
8
37
1.76
110197744--110197841
48
2.0
48
100
0
196
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14
32
1.69
110199815--110199935
23
5.2
23
67
16
79
23
13
16
46
1.82
110199800--110199937
47
3.0
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4
179
23
12
17
46
1.82
110201301--110201335
9
3.9
9
84
0
52
51
2
2
42
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110201301--110201335
18
1.9
18
94
0
61
51
2
2
42
1.31
110202291--110202323
16
2.1
16
100
0
66
36
12
6
45
1.66
110213573--110213599
13
2.1
13
100
0
54
29
14
14
40
1.86
110216958--110217085
39
3.3
39
89
0
202
31
21
26
21
1.98
110216957--110217111
78
2.0
76
85
5
204
30
21
27
20
1.98
110224927--110225053
39
3.3
39
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1
193
31
21
25
21
1.98
110224926--110225079
77
2.0
76
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195
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1.98
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0
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0
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1.03
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100
0
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0
0
1.00
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17
2.0
17
88
11
52
20
8
5
64
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378