Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  322  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.83
97949753--97950146
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28
21
21
1.99
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Period
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Copy
Number
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Score
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28
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27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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Entropy
(0-2)
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29
22
20
1.98
Indices
Period
Size
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Consensus
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Score
A
C
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(0-2)
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40
3.8
40
80
1
157
26
21
26
25
1.99
98123043--98123069
11
2.5
11
100
0
54
37
14
11
37
1.82
98128759--98128860
27
3.8
26
84
5
114
21
21
20
36
1.95
98130903--98131033
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
98130903--98131033
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
98139738--98139766
13
2.3
13
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41
31
0
27
1.56
98140110--98140191
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26
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0
146
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7
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1.83
98141786--98141890
27
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26
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5
129
20
23
20
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1.96
98149058--98149174
58
2.0
58
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218
23
7
33
35
1.83
98152576--98152632
28
2.0
28
93
0
96
38
12
15
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1.85
98157552--98157667
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1
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11
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98159125--98159231
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1.9
55
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11
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1.77
98159687--98159757
34
2.1
34
100
0
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15
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30
1.93
98163148--98163218
25
2.8
25
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8
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35
18
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1.96
98163296--98163369
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26
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2
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17
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1.84
98166103--98166137
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2.0
17
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5
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0
0
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1.9
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0
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2
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104
1.9
104
87
0
289
37
8
19
34
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98170690--98170719
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2.1
15
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30
0
10
1.30
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20
2.5
20
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25
15
11
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1.78
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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2.0
33
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2
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4
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17
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1.49
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1.46
98184325--98184367
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3.0
15
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63
34
6
4
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1.49
98184102--98184470
197
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193
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0
0
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0
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20
4.9
19
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22
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1
1
58
1.12
98185652--98185750
33
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33
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139
39
1
1
58
1.12
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20
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0
1
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0
0
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0
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136
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38
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2
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1.26
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20
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0
0
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24
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42
0
0
57
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0
0
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4.5
11
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22
52
66
5
0
27
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98186200--98186285
19
4.6
19
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1
0
40
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0
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0
0
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0.97
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20
5.0
20
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91
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1
0
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2.1
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2
0
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98186214--98186297
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2.5
35
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0
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98186360--98186442
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2.9
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0
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1.13
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7.7
46
87
7
471
37
15
24
22
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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