Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  52  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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14
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20
0
34
45
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
13095139--13095217
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18
0
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1.51
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20
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45
1.50
13095488--13095537
22
2.3
21
82
3
64
22
0
32
46
1.52
13095425--13095534
7
15.4
7
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11
53
24
0
26
49
1.51
13095529--13095569
14
2.9
15
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59
19
2
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34
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13095522--13095561
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1.9
21
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15
2
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40
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0
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0
0
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2.0
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25
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13103708--13103754
3
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3
100
0
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0
0
68
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20
1.9
20
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2
0
39
1.12
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0
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0
0
17
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2.0
22
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15
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27
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30
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1
40
1.34
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6
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30
0
0
70
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18
2.1
19
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0
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0
0
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2.0
21
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13107263--13107316
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2.1
26
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0
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116
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115
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2
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32
14
18
33
1.91
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6
7.7
6
78
21
53
0
21
0
78
0.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
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0
21
0
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13
3.8
13
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16
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0
21
0
78
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29
1.9
31
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6
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0
24
1
74
0.92
13118339--13118385
21
2.2
21
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11
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0
21
0
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0.75
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20
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2
6
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1.23
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0
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1.38
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36
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2.4
298
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0
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24
1.98
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223
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4.5
45
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1
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26
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1.95
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19
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19
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5.8
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2.3
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16
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9
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0
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10
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2.5
26
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2.7
25
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28
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103
28
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28
2
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63
1.30
13144224--13144308
24
3.6
24
73
17
88
29
0
7
63
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13144224--13144311
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2.0
44
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4
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29
0
6
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1.20
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2.0
23
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0
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10
31
10
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1.73
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22
2.0
22
87
8
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11
0
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1.38
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2
13.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.0
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1
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30
23
11
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4.8
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2
220
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16
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14
1.67
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4.7
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13
149
31
17
21
28
1.96
13189073--13189407
138
2.4
138
93
0
571
32
18
20
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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