Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  340  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102904408--102904456
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24
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4
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4
33
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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48
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2.0
27
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1.92
102937507--102937614
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102937891--102937934
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36
0
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61
1.09
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12
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186
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0
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4.8
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1.95
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434
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19
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30
1.94
102944037--102945802
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23.2
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73
13
1179
33
19
16
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
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1.94
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160
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872
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19
16
30
1.94
102945954--102946260
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4.0
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1.95
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3.8
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20
17
29
1.95
102946117--102946273
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17
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20
73
36
1
0
62
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.21
102981970--102982007
15
2.6
15
83
4
51
28
15
7
47
1.74
102981916--102982128
88
2.4
88
85
7
265
27
17
22
32
1.96
102982084--102982229
78
1.9
79
86
1
213
28
16
21
33
1.95
102982325--102982359
14
2.5
14
95
0
61
17
17
5
60
1.55
102982270--102982694
83
4.8
90
76
13
316
27
16
20
35
1.94
102984617--102984668
3
17.3
3
100
0
104
32
0
0
67
0.91
102985033--102985076
19
2.4
19
88
7
65
36
0
2
61
1.09
102985033--102985076
18
2.4
18
88
7
63
36
0
2
61
1.09
102985172--102985215
15
3.1
14
84
12
54
34
0
6
59
1.24
102985169--102985209
17
2.4
17
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0
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0
9
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1.32
102989409--102989482
25
3.0
24
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11
60
58
1
4
36
1.26
102989447--102989485
18
2.4
16
84
16
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0
5
33
1.18
102989566--102989608
20
2.2
20
82
0
50
67
0
2
30
1.03
102989596--102989651
25
2.2
26
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6
71
48
1
14
35
1.54
102990352--102990518
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1.9
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11
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1.84
102990352--102990564
89
2.4
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7
229
35
17
10
36
1.85
102990667--102990804
55
2.5
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1
5
28
1.26
102990829--102990861
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3.1
11
91
4
50
30
3
0
66
1.06
102990993--102991035
17
2.4
18
84
11
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4
0
55
1.20
102990946--102991019
38
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38
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5
105
36
2
2
58
1.27
102992188--102992232
19
2.6
16
83
16
54
31
24
0
44
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102996451--102996522
36
2.0
36
100
0
144
44
8
11
36
1.70
102997274--102997310
13
2.8
13
95
4
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18
29
24
27
1.98
102998567--102998692
60
2.1
60
91
2
209
34
0
11
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1.36
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3
12.3
3
100
0
74
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0
0
35
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5
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14
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14
26
1.84
103001324--103001373
20
2.6
19
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6
73
28
8
14
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1.70
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1.56
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2
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0
0
52
1.00
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15
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0
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0
0
50
1.00
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17
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0
57
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0
0
51
1.00
103008615--103008642
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7.0
4
100
0
56
25
25
0
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1.50
103017199--103017225
14
1.9
14
100
0
54
22
11
7
59
1.56
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87
3.9
89
86
4
469
28
15
20
35
1.93
103017055--103017559
89
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83
8
644
28
16
20
34
1.94
103017315--103017470
75
2.1
75
96
0
285
30
16
19
32
1.94
103017450--103017485
14
2.6
14
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0
54
25
11
5
58
1.54
103017464--103017721
74
3.3
75
80
13
302
28
15
20
34
1.94
103017700--103017735
14
2.6
14
95
0
63
25
11
5
58
1.54
103017539--103017809
88
3.1
89
88
5
408
27
15
20
36
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103017627--103017928
161
1.9
160
87
2
444
29
15
18
36
1.91
103017714--103017870
73
2.1
73
89
3
235
29
16
17
36
1.92
103017869--103018201
54
6.1
54
91
2
540
30
13
17
39
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103020450--103020489
17
2.4
17
87
4
55
27
5
5
62
1.37
103020587--103020642
14
3.9
15
75
17
55
42
3
5
48
1.43
103020583--103020642
27
2.2
27
85
5
77
41
3
6
48
1.46
103020829--103020872
24
1.9
22
82
17
54
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4
4
56
1.40
103023697--103024115
136
3.1
136
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0
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17
24
1.97
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2.1
27
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6
67
24
14
24
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1.93
103024383--103024458
26
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2.0
26
100
0
106
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1.58
103030583--103030666
27
3.1
27
87
0
105
22
35
25
16
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378