Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  69  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18039612--18039774
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2
0
55
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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25
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310
25
26
23
24
2.00
18161428--18161651
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2.8
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26
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2.00
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2.3
71
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18167490--18167687
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258
20
28
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0
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0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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117
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17
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1.94
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279
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1383
37
20
17
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
18207769--18207874
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39
22
13
24
1.90
18208030--18208203
70
2.5
70
85
4
219
34
22
14
28
1.93
18215348--18215455
53
2.0
53
100
0
216
15
26
18
38
1.91
18216400--18216435
12
3.0
12
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0
54
41
5
27
25
1.77
18216396--18216427
16
1.9
17
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57
40
6
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25
1.79
18218943--18219026
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34
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5
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4
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1.46
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2
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2
100
0
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0
0
50
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28
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7
0
49
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17
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0
18
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0
21
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18239302--18239349
13
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13
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20
51
37
43
0
18
1.51
18239374--18239422
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2.0
24
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0
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24
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2
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9
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4
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0
0
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16
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0
2
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1.12
18249310--18249339
15
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56
3
0
40
1.16
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37
2.1
37
84
0
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23
10
19
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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27
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8
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1.60
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21
2.0
21
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0
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36
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1.58
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2
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100
0
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0
0
48
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23
2.0
23
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8
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1.88
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2
28
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18286508--18286556
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28
1.98
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2.1
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2
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30
1.90
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0
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0
0
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0
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100
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22
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1.13
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7
0
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1.28
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0
0
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18312503--18312550
17
2.8
18
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20
59
72
0
0
27
0.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18314126--18314175
20
2.5
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2
2
46
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14
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2
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41
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1.74
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2.0
20
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0
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0
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0
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2.8
19
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8
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37
0
3
58
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378