Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  79  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21235787--21235998
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2.3
90
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4
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20
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21
1.98
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2.3
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225
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20
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1.98
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0
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0
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1.98
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1.8
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29
28
20
22
1.98
21249318--21249373
29
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1.12
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1.10
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1.10
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1
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25
2.0
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2
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2.0
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100
0
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30
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4.9
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2
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26
18
26
28
1.98
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28
3.2
28
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25
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23
16
29
29
1.96
21254975--21255204
100
2.3
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325
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18
26
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1.98
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26
2.0
26
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0
97
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26
2.0
26
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37
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16
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2.1
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0
500
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18
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3
88
0
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28
0
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4.0
12
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60
26
2
40
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1.68
21265519--21265565
21
2.2
21
96
0
85
31
14
17
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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12
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5
0
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1.21
21272224--21272290
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2.1
31
83
8
82
38
5
0
55
1.25
21276995--21277126
40
3.3
40
82
8
162
14
27
16
41
1.87
21277008--21277142
40
3.4
40
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2
155
14
26
17
41
1.88
21281196--21281262
30
2.2
30
97
0
125
16
28
34
20
1.95
21283097--21283237
41
3.4
41
78
6
133
21
19
26
31
1.97
21286629--21286676
5
9.2
5
77
8
51
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2
20
37
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17
4.7
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59
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19
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1.71
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15
6.1
15
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1.90
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15.6
17
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186
27
15
25
32
1.95
21290318--21290588
35
7.8
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6
222
27
15
25
32
1.95
21290317--21290587
70
3.9
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271
27
15
25
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1.95
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52
3.6
52
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5
168
26
13
26
33
1.93
21290333--21290588
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2.5
104
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26
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25
32
1.94
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17
3.2
17
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15
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35
32
13
18
1.90
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33
2.3
33
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0
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2.7
22
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0
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35
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14
100
0
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0
0
12
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19
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65
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0
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21
1.9
21
89
0
62
75
2
15
7
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21321030--21321063
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0
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2
23
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5
347
28
19
20
32
1.97
21322421--21323452
44
22.8
44
73
6
626
28
20
17
33
1.95
21322421--21323451
134
7.6
130
73
9
450
28
20
17
33
1.95
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45
11.7
43
70
13
174
29
21
15
32
1.95
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3.0
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284
28
22
15
33
1.94
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2.5
96
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0
328
28
21
17
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1.96
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44
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23
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12
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1.15
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19
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0
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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55
0
1
42
1.09
21373291--21373430
40
3.5
40
75
6
115
32
24
15
27
1.95
21382081--21382175
43
2.2
45
82
3
113
30
27
13
28
1.94
21383814--21383856
21
2.1
20
82
4
50
53
27
4
13
1.60
21384505--21384581
40
1.9
40
83
0
100
29
23
19
27
1.98
21385558--21385592
8
4.2
8
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3
61
51
0
0
48
1.00
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25
2.0
25
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0
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37
1.74
21396520--21396567
12
3.9
12
75
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39
4
18
37
1.70
21412382--21412425
21
2.1
21
100
0
88
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18
27
1.73
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34
2.2
34
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2
145
58
5
10
25
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16
2.3
15
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82
0
0
17
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40
6.6
40
90
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26
23
28
21
1.99
21428953--21429073
56
2.2
56
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217
52
9
20
16
1.72
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2
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27
22
27
22
1.99
21431889--21431918
14
2.1
14
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0
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1.55
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2
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1.23
21435401--21435430
15
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53
0
0
46
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4.9
64
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282
24
28
15
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1.95
21437371--21437687
132
2.4
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7
316
24
28
15
31
1.95
21438137--21438197
30
2.0
30
90
0
95
29
24
6
39
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
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0
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19
36
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2
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50
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21
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1.98
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24
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1.98
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1
0
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14
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0
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176
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0
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2.1
21
87
4
63
51
2
0
46
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21499877--21499937
23
2.4
26
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44
1.59
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22
2.1
23
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2
2
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1.24
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0
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0
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0
0
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0
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46
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2
182
40
11
25
22
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378