Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  323  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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72
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Indices
Period
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Number
Consensus
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Score
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2.7
207
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1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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11
2
17
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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51
55
0
44
0
0.99
98358424--98358467
22
2.0
22
90
0
70
68
0
2
29
1.02
98359158--98359184
14
1.9
14
100
0
54
59
11
7
22
1.56
98362595--98362700
42
2.5
42
87
3
151
32
14
24
29
1.94
98363346--98363397
25
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25
100
0
104
36
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19
36
1.80
98367887--98367916
2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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2
19.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
98377615--98377648
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12
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0
0
32
0.91
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27
2.0
27
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7
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38
5
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1.74
98383262--98383286
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8
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0
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0
0
52
1.00
98383964--98384050
44
2.0
44
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4
140
29
8
12
49
1.69
98384709--98384759
23
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24
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29
1
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1.67
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24
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0
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25
1.79
98386593--98386636
19
2.3
19
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0
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0
2
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1.13
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12
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0
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0
0
40
0.97
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43
4.0
43
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23
17
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1.97
98398531--98398638
46
2.4
46
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1
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38
7
20
33
1.80
98405607--98405834
46
5.0
46
92
1
350
21
23
14
39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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3
0
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1.12
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46
5.0
46
92
1
350
21
23
14
39
1.91
98413225--98413276
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
98414302--98414420
55
2.2
55
86
3
159
13
25
26
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1.93
98425210--98425312
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2
10
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2.3
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2
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1.98
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1.74
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16
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0
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19
1.64
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12
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0
53
0
25
0
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1.9
16
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0
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0
4
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0.78
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2.1
31
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0
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22
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1.99
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20
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20
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11
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17
53
31
20
12
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1.90
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4.0
12
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2
71
53
0
40
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1.26
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46
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21
21
28
28
1.98
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93
1.8
93
94
0
308
21
21
29
27
1.99
98469538--98469713
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46
79
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216
20
21
29
28
1.98
98469535--98469706
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98478986--98479059
25
3.0
25
89
0
112
37
5
17
39
1.73
98483723--98483916
48
4.1
48
71
12
148
29
26
18
26
1.98
98484375--98484475
49
2.1
49
100
0
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7
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1.85
98489785--98489811
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3.4
8
100
0
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0
0
37
0.95
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77
15
21
0
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1.31
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2.1
59
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0
207
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19
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1.90
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18
2.1
18
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10
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11
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18
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11
2
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1.43
98505483--98505623
27
5.3
26
85
6
185
34
24
22
17
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378