Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  75  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19965886--19965964
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19965897--19965973
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20039312--20039365
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2.8
15
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3
59
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2
0
51
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.00
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7
51
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0
0
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5.9
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0
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42
18
9
30
1.82
20082078--20082200
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3
86
39
16
13
30
1.86
20082078--20082196
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4.2
28
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0
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15
12
31
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1.9
120
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21
28
25
1.99
20086388--20086612
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5.7
40
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296
24
21
28
25
1.99
20086388--20086610
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328
24
21
27
25
1.99
20086388--20086645
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3.3
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21
27
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20089746--20090011
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2
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24
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0
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2.0
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51
20
16
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0
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0
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6
45
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.0
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13
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53
1.63
20105957--20106004
20
2.3
21
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27
16
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50
1.69
20114330--20114416
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2.0
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138
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14
54
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10.7
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100
0
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1.58
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100
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1.83
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100
0
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1.63
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0
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72
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17
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2.0
54
100
0
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9
18
28
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20158070--20158106
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1.80
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10
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27
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20176225--20176376
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84
5
200
25
23
26
24
2.00
20184298--20184499
40
5.1
40
75
9
148
23
24
27
24
2.00
20184297--20184448
78
1.9
79
84
5
200
25
23
26
24
2.00
20194509--20194689
40
4.6
40
78
8
165
24
24
27
23
2.00
20194508--20194659
78
1.9
79
84
5
200
25
23
26
24
2.00
20199187--20199551
46
8.0
46
87
1
482
20
22
15
40
1.90
20199236--20199551
137
2.3
138
91
1
517
20
23
15
40
1.91
20201644--20201688
3
15.7
3
78
17
51
68
0
2
28
1.01
20201650--20201688
11
3.5
11
92
0
69
69
0
2
28
1.02
20201678--20201726
20
2.5
20
86
6
64
55
6
2
36
1.37
20208254--20208342
42
2.1
42
87
4
126
24
30
21
23
1.99
20210051--20210100
2
25.0
2
79
0
55
46
6
4
44
1.47
20210328--20210370
8
5.4
8
91
0
50
44
6
6
41
1.58
20210328--20210378
16
3.2
16
82
0
66
45
5
5
43
1.52
20210335--20210389
4
13.8
4
80
0
65
45
5
3
45
1.44
20210335--20210389
6
9.2
6
83
0
65
45
5
3
45
1.44
20210053--20210618
288
2.0
288
97
1
1064
33
16
12
38
1.86
20218019--20218079
27
2.3
27
85
0
77
36
18
21
24
1.95
20217978--20218054
39
1.9
39
89
2
118
40
11
23
24
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20217964--20218144
67
2.7
67
92
2
285
35
17
22
24
1.95
20218046--20218121
40
1.9
40
86
0
107
38
15
22
23
1.93
20218438--20218483
21
2.1
22
88
4
67
4
2
52
41
1.33
20225101--20225208
26
4.2
26
95
0
198
32
7
25
35
1.84
20234613--20234772
51
3.2
50
91
1
248
29
23
15
32
1.95
20242413--20242572
51
3.2
50
91
1
248
29
23
15
32
1.95
20245404--20245492
36
2.4
37
84
1
117
34
14
6
43
1.72
20247228--20247260
16
1.9
17
88
11
50
3
15
3
78
0.99
20247226--20247286
28
2.2
28
85
5
79
3
14
8
73
1.19
20247363--20247387
12
2.1
12
100
0
50
60
0
0
40
0.97
20247360--20247391
14
2.3
15
89
10
50
62
0
0
37
0.95
20250708--20250847
27
5.2
28
90
5
184
35
22
24
18
1.96
20250950--20251024
28
2.8
27
86
6
91
32
13
20
34
1.91
20252469--20252550
26
3.2
26
96
0
155
36
26
6
30
1.81
20254365--20254450
18
4.7
18
82
1
100
40
13
9
36
1.77
20254365--20254450
36
2.4
37
84
2
111
40
13
9
36
1.77
20254589--20254694
47
2.3
47
93
3
178
39
23
20
16
1.92
20254572--20254686
47
2.3
50
79
13
146
42
23
18
15
1.88
20256382--20256417
2
18.5
2
94
5
65
50
0
0
50
1.00
20256494--20256556
31
2.0
32
84
9
85
49
4
0
46
1.23
20261290--20261375
18
4.7
18
78
7
84
41
15
6
36
1.74
20261291--20261378
36
2.4
37
79
5
108
40
15
7
35
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20265936--20265981
21
2.3
20
78
14
51
30
6
17
45
1.73
20271962--20272006
22
2.0
22
83
8
56
40
6
0
53
1.27
20273819--20274040
67
3.4
64
77
9
232
31
15
29
23
1.95
20280217--20280259
22
2.0
22
100
0
86
18
18
25
37
1.94
20280220--20280334
22
5.8
21
68
22
79
18
17
27
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1.93
20280228--20280345
38
3.1
38
88
0
182
16
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29
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1.93
20290682--20290732
20
2.5
20
100
0
102
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40
0
0
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2.0
20
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0
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41
20
2
35
1.66
20314789--20315013
122
1.9
121
86
2
326
24
20
13
41
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378