Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  23  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5955056--5955593
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132
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28
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0
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5979945--5980045
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4.2
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77
15
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3
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5979945--5980062
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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17
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24
2.1
24
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0
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3
23
45
1.70
5984816--5984874
24
2.6
22
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3
23
38
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5985355--5985383
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5985739--5985770
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21
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5
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24
2.1
24
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3
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1.70
5997127--5997185
24
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33
3
23
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0
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0
0
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3.3
28
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96
37
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11
32
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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19
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22
22
27
1.99
6000863--6001030
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1.99
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0
62
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6011437--6011468
16
2.0
16
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0
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21
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1.71
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2
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1.28
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18
6
6
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12
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2
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29
2.1
29
100
0
122
19
14
3
62
1.46
6013902--6013944
21
2.0
22
86
4
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39
0
0
60
0.97
6015915--6015975
18
3.4
18
81
0
77
32
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37
1.87
6025424--6025517
18
5.3
18
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5
138
39
10
12
37
1.78
6025424--6025515
35
2.6
35
94
3
157
39
10
11
38
1.77
6028646--6028695
13
3.6
13
80
15
64
18
0
26
56
1.42
6028633--6028695
29
2.2
30
88
8
103
17
0
26
55
1.42
6029770--6029835
25
2.8
24
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19
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42
7
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40
1.65
6030226--6030266
13
3.1
13
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16
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2
2
43
1.28
6031871--6032318
27
16.6
27
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1
540
27
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1.84
6033648--6033708
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3.0
20
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0
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1.89
6033757--6033875
24
5.0
24
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170
28
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1.99
6033757--6033875
47
2.5
48
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170
28
21
22
26
1.99
6034067--6034130
31
2.1
31
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0
101
35
15
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1.94
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26
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26
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1.45
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2.1
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7
30
1.54
6036310--6036412
6
17.2
6
98
0
152
61
0
5
33
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
48
1.00
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27
13.7
27
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19
20
25
1.96
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27
4.0
28
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136
20
20
20
38
1.94
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27
2.1
27
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15
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24
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1.95
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31
2.4
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1.73
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26
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1.76
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18
1.9
17
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2
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2
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2
2
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1.32
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1
0
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15
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0
0
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29
1
0
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20
2.2
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50
44
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21
2.0
21
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30
1.96
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30
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4
1.15
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29
2.9
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125
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3
1.15
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2.6
25
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140
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20
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3.0
72
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10
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30
17
18
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1.94
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121
2.0
121
95
0
429
31
16
18
33
1.93
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75
12.1
74
81
8
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30
16
19
33
1.93
6051712--6052481
149
5.1
149
90
3
1055
32
16
18
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6052629--6052690
30
2.1
30
90
6
99
19
9
29
41
1.83
6053363--6053461
32
3.1
32
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8
132
70
20
5
4
1.22
6054255--6054280
3
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100
0
52
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0
0
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27
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1.38
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2.1
24
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75
38
4
20
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1.72
6063707--6063757
24
2.1
24
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0
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45
1.70
6063699--6063757
24
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0
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0
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16
2.0
16
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0
55
21
21
6
50
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378