Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  279  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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84127743--84127906
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1.99
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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11
40
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84234277--84234377
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5
58
1.44
84239800--84239855
23
2.4
24
87
3
78
21
1
7
69
1.22
84239847--84239915
29
2.6
25
78
17
68
31
7
0
60
1.24
84239867--84239950
33
2.8
29
75
19
89
34
3
0
61
1.13
84241609--84241635
10
2.7
10
100
0
54
11
33
25
29
1.91
84252469--84252521
17
2.9
19
75
13
58
67
1
0
30
1.01
84258167--84258201
18
1.9
18
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0
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0
20
60
1.37
84263838--84263898
29
2.1
29
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6
79
19
22
29
27
1.98
84264716--84264750
18
1.9
18
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0
52
20
0
20
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1.37
84266766--84266815
24
2.0
25
88
3
75
64
0
2
34
1.05
84266861--84267079
20
10.9
19
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23
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60
1
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35
1.22
84266880--84267060
3
59.3
3
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61
1
2
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1.20
84266905--84266965
25
2.4
25
78
13
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62
3
1
32
1.21
84266881--84267085
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47
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61
1
2
34
1.18
84268622--84269388
210
3.7
210
89
2
1075
28
21
18
30
1.97
84281164--84281213
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2.0
25
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58
0
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1.17
84281420--84281469
24
2.0
25
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64
0
2
34
1.05
84281485--84281714
3
74.3
3
66
23
79
60
1
3
33
1.25
84281515--84281733
20
10.9
19
70
23
82
60
1
2
35
1.22
84281559--84281619
25
2.4
25
78
13
72
62
3
1
32
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84281535--84281739
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4.4
47
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15
133
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1
2
34
1.18
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4
7.8
4
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0
53
70
0
25
3
1.02
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1
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1
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0
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0
5
0
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3
15.7
3
100
0
94
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0
0
31
0.90
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19
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1
1
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1.03
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27
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53
1
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1.40
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2.0
22
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28
1.44
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177
1.8
177
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0
478
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1.97
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1.97
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2.0
64
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0
220
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14
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1.89
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2.1
21
86
0
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1.58
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2.3
71
100
0
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18
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17
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71
2.8
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3
258
20
28
17
33
1.95
84325980--84326143
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
84325980--84326177
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
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1.95
84328470--84328627
3
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18
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2
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28
7
0
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1.22
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17
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16
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55
34
0
12
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1.39
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19
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34
0
1
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5.2
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20
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3
3
59
1.30
84328864--84328982
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2.8
42
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125
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1.30
84329163--84329226
31
2.0
32
87
3
94
37
6
4
51
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84336971--84337019
19
2.6
19
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0
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6
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30
1.71
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18
2.0
18
88
0
54
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0
0
38
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1.9
23
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4
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44
0
2
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1.13
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2
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2
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0
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2.2
28
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3
3
36
1.31
84348675--84348729
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1.9
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23
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100
0
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0
0
44
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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