Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  373  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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4.8
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19
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1083
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184
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111455359--111455466
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2.1
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1
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
31
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1
46
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2.4
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1
0
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2.1
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22
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53
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2
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
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(0-2)
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2.4
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22
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1.9
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15
25
17
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1.9
126
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16
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1.90
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4
28
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58
1
0
40
1.08
111556045--111556080
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4.9
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16
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63
0
0
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2.1
24
100
0
100
54
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0
24
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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31
2.1
31
84
0
83
31
10
14
43
1.79
111604043--111604112
34
2.1
34
100
0
140
48
20
14
17
1.81
111609495--111609570
30
2.4
30
89
10
109
47
9
17
26
1.77
111610757--111610785
14
2.1
14
100
0
58
27
13
13
44
1.82
111618669--111618705
8
4.6
8
100
0
74
37
0
0
62
0.96
111618728--111618769
5
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5
100
0
84
40
0
0
59
0.97
111619092--111619148
15
3.9
15
90
2
89
36
0
12
50
1.40
111619533--111619649
21
5.5
21
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2
153
14
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26
35
1.93
111619520--111619649
63
2.0
64
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2
172
16
23
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111621650--111621753
38
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42
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14
119
24
24
36
15
1.93
111621699--111621958
104
2.5
105
83
6
318
25
24
29
20
1.99
111622058--111622101
22
2.0
22
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8
54
22
15
29
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1.95
111622752--111622799
22
2.2
22
96
0
87
39
10
2
47
1.49
111622820--111622866
13
3.5
13
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13
60
40
0
0
59
0.97
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16
2.0
17
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30
0
0
69
0.88
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14
2.1
14
100
0
58
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6
44
1.58
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8
24
1.56
111632469--111632518
3
18.0
3
80
15
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0
2
32
1.03
111632469--111632515
13
3.7
13
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2
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65
0
2
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1.04
111635257--111635407
53
2.8
53
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4
214
25
16
27
29
1.97
111651318--111651414
33
2.9
33
89
1
149
37
12
5
45
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111652064--111652150
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2.0
44
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2
149
31
3
17
48
1.64
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2
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2
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0
50
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0
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1.00
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12
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0
56
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1.80
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2
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2
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50
0
0
50
1.00
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2.0
42
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1.76
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2
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0
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0
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0
8
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0
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0
5
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1.11
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24
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0
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0
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100
0
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0
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19
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40
2
0
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1.12
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26
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1
0
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131
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17
26
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22
2.3
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39
0
1
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2.0
27
100
0
110
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14
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70
0
10
20
1.16
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0
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34
0
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111697557--111697654
49
2.0
49
100
0
196
30
12
24
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111700477--111700533
29
2.0
29
89
0
87
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15
2.0
15
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0
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0
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0
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0
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1
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0
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0
0
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1
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1.43
111724317--111724381
9
7.7
9
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23
15
1
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111724311--111724381
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2.0
35
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0
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67
2.2
67
91
2
235
31
4
20
44
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378