Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  68  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17805118--17805150
2
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2
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0
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0
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0
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2.0
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919
31
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1.96
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2
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1.07
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28
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17825214--17825343
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23
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2.00
17825176--17825343
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2.00
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2.0
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2.2
20
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50
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2.5
60
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0
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5
6
39
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.4
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2.4
22
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0
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2.2
42
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2
2
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1.9
13
100
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0
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0
0
13
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17865234--17865274
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31
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0.90
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2.5
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1.95
17870276--17870357
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27
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8
78
29
15
24
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17878102--17878171
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2.5
28
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30
1.95
17878102--17878183
27
3.0
27
85
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78
29
15
24
30
1.96
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84
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21
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1.99
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62
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21
22
25
1.99
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163
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20
21
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1.98
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11
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17880926--17881004
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4.2
19
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117
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11
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1.85
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32
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102
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10
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14
11
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17887651--17887837
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0
16
0
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0.64
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18
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18
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256
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14
11
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17896947--17897125
35
5.0
35
89
6
270
36
14
11
37
1.82
17896947--17897125
53
3.3
54
89
5
274
36
14
11
37
1.82
17897891--17898361
83
5.7
83
91
0
739
27
20
19
32
1.97
17898207--17898725
206
2.5
203
71
17
494
28
21
18
31
1.96
17898721--17898900
44
4.1
44
72
8
168
28
25
16
30
1.96
17899813--17899862
24
2.1
24
96
0
91
0
14
0
86
0.58
17899813--17899860
6
7.8
6
86
13
71
0
14
0
85
0.60
17899816--17899872
24
2.3
24
87
3
78
0
15
0
84
0.63
17905393--17905440
22
2.2
21
78
10
51
37
16
6
39
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17905419--17905597
18
9.9
18
88
4
256
36
13
11
38
1.81
17905419--17905597
35
5.0
36
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267
36
13
11
38
1.81
17905412--17905597
53
3.5
54
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8
274
36
14
10
38
1.81
17906792--17906845
27
2.0
28
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10
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5
44
14
1.69
17917301--17917366
28
2.4
28
94
0
114
33
27
7
31
1.85
17917471--17917559
28
3.2
27
85
10
119
20
23
23
32
1.98
17917471--17917559
26
3.2
27
85
7
117
20
23
23
32
1.98
17918020--17918058
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
17918637--17918670
10
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10
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50
29
8
8
52
1.62
17925069--17925133
28
2.3
28
94
0
112
33
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7
30
1.85
17925239--17925328
28
3.2
27
85
7
119
20
24
23
32
1.98
17925239--17925353
55
2.1
56
83
8
146
19
24
21
34
1.96
17925791--17925829
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17928627--17928757
29
4.5
29
78
5
122
25
17
32
25
1.97
17941222--17941432
39
5.4
39
94
1
334
23
31
20
24
1.98
17941222--17941432
77
2.7
78
90
2
334
23
31
20
24
1.98
17941222--17941432
116
1.8
117
92
1
361
23
31
20
24
1.98
17944766--17944850
42
2.0
42
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0
152
45
7
11
35
1.68
17945514--17945654
75
1.9
75
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2
185
25
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16
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1.94
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105
2.1
105
88
0
329
24
24
29
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1.99
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2
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100
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0
0
50
1.00
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4.8
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23
29
24
1.99
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4.6
46
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10
190
29
18
28
24
1.98
17977779--17978000
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4.7
48
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10
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18
28
23
1.98
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140
1.8
140
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4
342
29
17
28
24
1.98
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2.8
51
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4
232
29
24
12
32
1.93
17984591--17984691
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25
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26
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2.0
63
92
0
207
24
23
15
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2.1
16
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11
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63
12
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1.51
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1.9
74
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1
206
57
9
2
30
1.45
18006237--18006557
159
2.0
160
96
0
590
40
16
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1.78
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4
0
42
1.19
18008037--18008097
21
2.9
20
79
13
61
73
0
3
22
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18008037--18008097
8
7.9
8
79
15
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0
3
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0.97
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2
15.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.6
28
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21
36
20
22
1.96
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29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
18019486--18019560
28
2.6
28
78
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21
36
20
22
1.96
18019544--18019617
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2.6
29
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0
139
27
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1.95
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0
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0
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18
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18
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1.95
18032075--18032272
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2.8
70
90
3
249
20
28
17
32
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378