Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  168  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
1.97
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
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A
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(0-2)
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1.30
49176361--49176443
26
3.3
24
79
15
89
56
4
2
36
1.34
49176376--49176443
26
2.8
23
86
10
91
54
5
2
36
1.40
49176428--49176459
6
5.7
6
85
14
50
53
15
0
31
1.43
49176917--49176981
24
2.6
25
80
11
80
64
3
4
27
1.28
49178527--49178575
21
2.3
21
78
0
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26
28
12
32
1.92
49178693--49179012
85
3.7
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2
419
36
20
15
27
1.93
49178929--49179149
75
2.9
74
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7
300
32
21
15
29
1.95
49178918--49179145
78
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78
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32
21
16
29
1.95
49178844--49179149
153
2.0
153
83
5
391
33
20
16
29
1.94
49187451--49187495
22
2.0
22
91
0
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48
4
17
28
1.66
49191072--49191133
27
2.3
27
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10
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59
4
3
32
1.34
49191341--49191384
23
1.9
23
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0
61
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29
1.50
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50
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49
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8
124
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3
8
32
1.47
49191443--49191559
13
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13
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1
34
1.35
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2.5
25
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3
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1.34
49191434--49191484
12
4.4
11
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3
0
33
1.13
49191481--49191563
11
7.0
11
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2
34
1.44
49191456--49191548
26
3.8
24
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13
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58
4
2
35
1.30
49191533--49191564
6
5.7
6
85
14
50
53
15
0
31
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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11
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0
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57
15
0
26
1.38
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15
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15
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69
2
2
25
1.14
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24
1.9
22
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45
2
22
29
1.65
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17
2.4
17
84
15
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60
2
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29
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1.94
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1.95
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1.94
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1.48
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189
37
0
17
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18
2.0
18
100
0
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0
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19
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0
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58
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21
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2.0
25
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30
18
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14
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0
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0
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102
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28
0
21
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21
2.0
20
86
13
57
25
7
0
67
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
49221791--49221970
50
3.7
48
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154
25
27
18
27
1.98
49229395--49229509
46
2.5
46
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5
151
20
29
21
27
1.98
49234955--49235103
80
1.9
80
81
2
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22
1.99
49234996--49235103
40
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128
21
29
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1.99
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4.9
45
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153
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49239038--49239257
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223
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24
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1.92
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0
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0
0
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43
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2.0
26
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72
24
13
22
39
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378