Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  313  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95274504--95274560
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2.5
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1.9
16
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41
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2
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1.95
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1.99
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95352176--95352221
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4.1
12
72
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53
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13
2
56
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.93
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1.91
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34
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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44
1.12
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7
3.6
7
100
0
50
0
28
16
56
1.41
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2
15.5
2
93
6
53
53
0
0
46
1.00
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40
91
0
125
35
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23
2.0
23
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0
63
40
20
11
28
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5
20.2
5
70
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73
1
5
18
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95458871--95458923
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75
1
1
20
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95458870--95458923
14
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14
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1
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20
0.98
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24
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19
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21
2.0
21
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0
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23
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19
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13
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4
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48
12
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39
1.40
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79
2.0
79
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0
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17
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19
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130
2.0
130
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499
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29
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33
0
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2.1
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0
0
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37
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0
0
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10
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2
0
26
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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1.11
95504800--95504838
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18
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0
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20
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0
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0
0
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0
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29
28
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2.0
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0
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4.0
126
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2
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28
17
16
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95544492--95544604
34
3.4
34
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2.2
40
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0
126
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1.88
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1
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24
100
0
100
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143
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488
28
24
18
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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