Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  12  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3444600--3444810
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132
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0
0
50
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100
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0.82
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0
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22
5
3
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
29
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110
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15
6
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1.15
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29
2.4
34
76
18
96
74
16
6
2
1.13
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17
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17
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2.0
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10
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5
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116
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117
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309
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15
22
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1.93
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4.8
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11
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28
15
18
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1.91
3532782--3532858
32
2.4
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6
2
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17
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10
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2.0
23
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100
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2.4
22
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1
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2.0
36
94
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5
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2.2
20
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2
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3
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0
66
66
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0
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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0
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1.9
24
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65
62
0
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35
1.08
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312
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17
19
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2.5
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17
17
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1.8
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28
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19
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1.94
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1.9
240
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621
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17
19
32
1.95
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4.3
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426
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17
18
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1.94
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459
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35
22
12
29
1.91
3592655--3592849
69
2.8
69
87
1
257
35
22
12
29
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3594847--3594905
29
2.0
29
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0
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10
10
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0
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0
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0
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61
0
44
0
55
0.99
3606583--3606643
3
20.0
3
86
3
86
31
1
4
62
1.26
3606828--3606886
29
2.1
29
82
14
72
25
10
1
62
1.36
3606850--3606900
21
2.3
22
83
12
61
25
11
1
60
1.41
3619494--3619627
71
1.9
71
87
3
198
31
15
22
30
1.95
3619654--3619787
71
1.9
71
90
0
214
30
16
23
29
1.96
3619395--3619945
160
3.5
160
98
0
1059
29
16
21
32
1.95
3619813--3619993
71
2.5
72
86
4
240
32
17
21
28
1.96
3619958--3620158
54
3.7
54
84
6
255
29
13
18
37
1.90
3620945--3620978
14
2.4
14
100
0
68
29
55
8
5
1.54
3621547--3621576
15
1.9
16
93
6
53
0
43
0
56
0.99
3622020--3622080
3
20.0
3
86
3
86
31
1
4
62
1.26
3622266--3622324
29
2.1
29
82
14
72
25
10
1
62
1.36
3622288--3622338
21
2.3
22
83
12
61
25
11
1
60
1.41
3624096--3624130
17
2.1
17
94
0
61
22
17
14
45
1.84
3625244--3625277
17
2.0
17
88
0
50
41
0
5
52
1.25
3626368--3626547
88
2.0
88
97
0
342
31
23
13
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3628664--3628690
4
6.8
4
100
0
54
77
0
22
0
0.76
3629873--3629915
18
2.4
18
84
7
52
18
2
4
74
1.10
3634134--3634185
16
3.3
16
70
24
56
53
9
3
32
1.51
3634127--3634198
31
2.4
30
84
11
94
51
6
2
38
1.43
3636989--3637310
46
6.8
46
67
16
144
27
18
29
25
1.98
3640627--3640674
7
7.0
7
81
9
55
18
2
0
79
0.84
3640853--3640941
3
29.0
3
80
8
99
30
5
2
61
1.31
3641194--3641261
28
2.7
24
74
24
59
25
8
5
60
1.49
3641290--3641419
9
15.9
9
69
22
65
29
8
2
60
1.39
3641316--3641419
3
35.7
3
72
12
74
31
7
1
58
1.37
3641310--3641399
39
2.4
38
80
10
96
32
8
1
57
1.37
3646314--3646345
10
3.3
10
95
4
57
93
0
6
0
0.34
3646314--3646346
17
1.9
17
93
0
57
90
0
9
0
0.44
3646436--3646477
6
7.0
6
94
0
75
50
19
30
0
1.48
3648133--3648326
67
3.0
66
87
3
266
31
17
12
38
1.86
3648398--3648648
43
5.9
43
70
10
158
35
22
20
22
1.96
3648495--3649239
44
17.0
44
69
15
320
35
21
21
21
1.96
3648415--3648913
89
5.7
87
80
6
478
34
21
22
21
1.97
3648755--3649088
132
2.5
132
86
1
429
34
21
22
21
1.97
3648890--3649214
175
1.9
176
88
3
503
35
21
23
20
1.96
3648887--3649214
87
3.7
88
84
4
430
35
21
22
20
1.96
3648529--3649176
132
4.9
132
75
7
408
34
21
22
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3649443--3649512
36
1.9
36
85
0
95
31
20
22
25
1.98
3650952--3650999
7
7.0
7
81
9
55
18
2
0
79
0.84
3651178--3651257
3
26.0
3
77
9
81
30
6
2
61
1.34
3651510--3651577
28
2.7
24
74
24
59
25
8
5
60
1.49
3651606--3651735
9
15.9
9
69
22
65
29
8
2
60
1.39
3651632--3651735
3
35.7
3
72
12
74
31
7
1
58
1.37
3651626--3651715
39
2.4
38
80
10
96
32
8
1
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1.37
3653525--3653557
2
16.5
2
100
0
66
48
0
0
51
1.00
3663150--3663255
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2.0
53
98
0
203
48
20
14
16
1.81
3666438--3666474
15
2.5
15
95
0
65
45
0
2
51
1.15

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378