Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  28  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6857578--6857811
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127
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2.0
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12.0
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21
21
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2.5
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133
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18
26
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1.98
6872935--6873046
44
2.5
45
84
7
131
28
18
26
25
1.98
6875612--6875775
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2.2
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14
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2
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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2
5
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1.34
6883279--6883330
18
2.9
18
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3
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1.35
6887400--6887442
18
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23
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22
2.1
22
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0
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19
0
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24
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206
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2.5
54
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236
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2.4
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2.1
15
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35
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4.2
26
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5
23
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6930796--6930905
52
2.1
52
94
0
193
34
5
23
36
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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137
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2.0
35
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12
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1.92
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2.0
35
97
0
131
12
25
35
25
1.92
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2.4
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13
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14
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4.6
44
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24
18
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1.97
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36
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37
23
15
23
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6993532--6993560
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5
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0
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0
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0
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0
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0
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19
1.98
6999651--6999705
27
2.0
27
100
0
110
41
18
29
10
1.84
7006261--7006566
134
2.3
134
89
1
452
28
20
22
29
1.98
7006572--7007362
84
9.4
83
89
2
1116
36
21
22
18
1.95
7006629--7007019
40
9.4
40
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21
106
36
23
21
17
1.94
7009573--7009641
3
23.3
3
85
2
86
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1
5
31
1.29
7009860--7009968
3
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3
88
3
123
61
0
7
30
1.29
7011859--7012362
43
11.6
43
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12
271
20
23
21
35
1.96
7011908--7012326
44
9.6
44
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16
210
19
23
21
35
1.96
7011865--7012362
87
5.7
87
90
1
757
20
23
21
35
1.96
7020773--7020815
18
2.3
19
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11
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34
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25
1.93
7021155--7021226
3
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2
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59
1
5
33
1.29
7021449--7021547
3
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2
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1
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1.15
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32
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32
100
0
134
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2
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15
3.6
15
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19
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57
1
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29
1.42
7023121--7023151
15
2.1
14
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5
53
25
3
0
70
1.02
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20
1.9
20
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0
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26
5
0
68
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7023126--7023170
20
2.2
20
80
7
56
31
6
0
62
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
40
100
0
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12
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24
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48
2.0
48
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0
156
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4
28
29
1.75
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26
2.0
27
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7
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28
15
18
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31
2.9
32
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1
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27
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1.80
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1.78
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1.96
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35
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20
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11
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25
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25
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27
1.97
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3
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2
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17
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2
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0
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0
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0
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2.3
206
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0
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20
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11
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11
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29
55
32
2
0
64
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7059179--7059247
3
22.7
3
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19
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2
0
65
1.08
7059179--7059286
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2
0
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1.15
7059113--7059250
12
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11
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31
4
1
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1.23
7059186--7059289
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37
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2
0
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2.0
22
100
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1.98
7065096--7065344
137
1.8
137
98
0
480
30
23
19
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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