Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  67  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17425005--17425114
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23
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2.3
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2.2
20
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51
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4
18
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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3.2
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109
28
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23
18
27
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
24
2.00
17602858--17603081
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26
23
24
2.00
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2.0
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17604938--17604997
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53
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0
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0
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16
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1.85
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22
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6
6
60
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17674832--17674916
28
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28
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14
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32
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58
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25
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26
69
12
115
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6
3
55
1.44
17678944--17678989
9
4.8
10
80
20
62
21
19
6
52
1.69
17678944--17678998
19
2.9
19
91
5
85
25
18
5
50
1.67
17684759--17684911
39
3.9
39
92
0
252
23
20
32
23
1.98
17684760--17684941
39
4.6
39
89
0
247
23
21
31
23
1.98
17690316--17690621
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45
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32
20
21
25
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17690687--17690851
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3.7
44
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10
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19
21
28
1.98
17692492--17692541
22
2.3
21
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16
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60
1.48
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58
1.36
17692628--17692683
27
2.1
26
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5
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2
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1.40
17696079--17696118
5
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22
0
2
75
0.93
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31
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0
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15
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0
10
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1.36
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27
2.9
27
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0
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0
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5.2
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18
0
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0.80
17720300--17720362
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2.0
32
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19
0
1
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0.82
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15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17721902--17721964
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26
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0
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13
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0
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32
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1.94
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14
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0
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1.05
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4
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0
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32
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1.93
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0
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0
0
16
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0
72
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0
0
16
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18
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0
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0
0
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25
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0
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1.50
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7
12
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26
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0
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2.1
18
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43
2.9
45
81
11
165
33
8
10
48
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17798536--17798600
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2.0
32
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0
130
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47
1.81
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2
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2
100
0
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0
0
48
1.00
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2.0
22
95
0
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2.1
42
95
0
160
39
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38
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125
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8
8
49
1.62
17799321--17799430
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134
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0
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0
0
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1.00
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2.0
29
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0
87
24
7
8
59
1.52

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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