Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  138  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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127
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22
22
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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A
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(0-2)
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2.4
40
86
8
126
40
4
17
37
1.69
39401018--39401170
20
7.7
19
71
16
80
39
4
17
38
1.70
39401354--39401584
20
11.6
19
66
23
88
36
6
16
40
1.74
39401320--39401410
40
2.3
40
83
5
105
36
6
17
39
1.76
39401481--39401584
40
2.6
40
78
4
111
34
6
17
41
1.76
39402114--39402168
27
2.0
28
96
3
103
50
14
5
29
1.65
39404010--39404182
46
3.7
44
73
13
141
28
19
29
22
1.98
39404008--39404230
95
2.3
95
81
7
229
29
19
28
23
1.98
39406120--39406287
46
3.6
47
78
15
163
29
18
28
23
1.98
39406120--39406373
140
1.8
140
84
3
350
28
18
29
23
1.98
39406120--39406385
47
5.7
46
77
9
216
28
18
28
23
1.98
39414456--39414665
46
4.5
48
79
9
174
27
20
28
24
1.99
39417324--39417482
87
1.8
86
83
1
210
38
18
11
30
1.87
39439033--39439073
18
2.2
20
86
8
59
34
0
2
63
1.08
39446216--39446256
3
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3
100
0
82
65
0
0
34
0.93
39446282--39446462
81
2.3
75
81
7
193
35
7
12
45
1.69
39446500--39446530
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
39446992--39447071
29
2.8
28
75
1
79
35
17
21
26
1.95
39457136--39457199
18
3.5
19
70
18
55
62
6
1
29
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39457469--39457531
19
3.2
19
75
24
60
65
1
1
31
1.12
39457563--39457591
7
4.1
7
100
0
58
72
0
0
27
0.85
39465115--39465221
53
2.0
53
90
0
169
39
12
16
31
1.86
39466145--39466187
18
2.4
18
88
7
61
53
0
0
46
1.00
39483028--39483071
19
2.4
18
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7
70
43
13
2
40
1.57
39486948--39486996
20
2.6
19
87
9
73
46
12
2
38
1.53
39491796--39491833
18
2.1
18
95
0
67
34
10
26
28
1.90
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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49
4.7
48
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2
321
32
9
29
28
1.88
39510202--39510427
96
2.4
93
87
3
317
32
9
29
27
1.89
39512718--39512743
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
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2.1
47
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0
137
33
10
29
28
1.89
39514677--39514812
50
2.7
50
97
0
254
37
5
25
31
1.80
39514962--39515069
37
2.9
37
94
0
180
24
18
31
25
1.97
39532839--39533027
50
3.8
51
81
6
199
26
19
25
29
1.98
39541903--39541930
5
5.6
5
100
0
56
82
0
0
17
0.68
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29
2.0
31
83
10
77
37
0
6
55
1.27
39555091--39555143
22
2.5
22
87
3
72
26
20
15
37
1.92
39555254--39555311
18
3.1
18
80
7
62
29
22
18
29
1.98
39557837--39557993
56
2.8
55
90
4
219
26
24
13
35
1.92
39557837--39557993
28
5.6
28
86
4
194
26
24
13
35
1.92
39560073--39560131
16
3.4
17
71
17
57
61
1
3
33
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39561579--39561624
2
23.0
2
100
0
92
50
0
0
50
1.00
39563962--39564124
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1.9
88
89
1
256
40
12
9
38
1.75
39565326--39565358
2
16.5
2
100
0
66
0
48
0
51
1.00
39590154--39590255
52
2.0
52
90
3
161
51
3
25
18
1.63
39592181--39592329
18
8.3
18
88
1
201
33
14
13
38
1.86
39592181--39592329
54
2.8
54
89
2
228
33
14
13
38
1.86
39593250--39593276
13
2.1
13
100
0
54
40
7
0
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1.30
39593716--39593767
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2.6
20
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0
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3
32
7
55
1.46
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3.2
13
81
18
52
54
2
0
42
1.13
39600330--39600361
15
2.0
17
88
11
50
25
0
31
43
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378