Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  92  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24955467--24955735
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20
17
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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56
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2.0
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13
37
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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1.95
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15
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
121
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417
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17
16
31
1.93
25037833--25037938
54
1.9
55
83
5
135
38
18
14
28
1.90
25037918--25037951
13
2.5
13
90
4
50
58
8
11
20
1.59
25037789--25038136
140
2.5
140
94
2
608
37
20
16
25
1.93
25037973--25038078
54
1.9
54
81
9
126
37
17
15
29
1.91
25038069--25038234
72
2.3
71
86
4
235
42
20
15
22
1.89
25038109--25038355
122
2.0
123
89
4
383
40
22
13
24
1.90
25038234--25038408
71
2.5
70
85
3
219
34
24
13
27
1.92
25045977--25046055
30
2.8
29
90
5
126
3
5
20
70
1.22
25045978--25046058
29
2.9
27
87
12
119
3
4
19
71
1.20
25045977--25046058
27
2.9
29
87
5
123
3
4
19
71
1.19
25048127--25048238
42
2.7
43
85
2
165
31
25
17
25
1.97
25053387--25053437
14
3.7
14
75
12
52
35
0
3
60
1.15
25054099--25054161
22
2.9
21
76
6
72
44
36
0
19
1.51
25054425--25054531
40
2.7
39
81
11
112
30
18
24
26
1.98
25058858--25058972
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
25058858--25058972
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
25060589--25060698
26
4.2
26
95
0
175
36
24
6
32
1.81
25064256--25064356
30
3.5
30
81
4
109
30
15
23
29
1.96
25070682--25070779
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25078264--25078401
62
2.2
62
82
10
156
29
15
18
35
1.93
25078391--25078486
42
2.3
43
83
8
117
34
18
15
31
1.93
25082451--25083055
311
2.0
309
90
2
953
34
20
12
32
1.90
25087805--25087859
22
2.5
22
80
11
67
18
21
16
43
1.88
25092024--25092114
19
4.8
19
71
10
78
39
20
5
34
1.76
25091972--25092104
57
2.3
57
83
6
162
41
21
4
33
1.73
25092295--25092383
24
3.7
24
81
3
99
32
19
23
24
1.97
25094252--25094315
31
2.1
31
90
0
101
25
23
15
35
1.94
25094509--25094698
24
8.0
24
89
4
269
26
21
22
28
1.99
25094508--25094699
47
4.0
48
89
4
282
26
21
22
29
1.99
25094509--25094699
71
2.7
72
88
4
280
26
21
22
29
1.99
25094757--25094833
9
7.9
9
72
16
64
35
22
7
35
1.83
25094753--25094835
20
4.2
20
95
0
148
32
20
10
36
1.87
25094764--25094835
11
7.1
11
70
17
66
33
20
9
36
1.86
25097383--25097514
29
4.6
29
94
0
219
25
32
15
26
1.95
25097354--25097514
58
2.8
58
88
0
187
25
33
15
25
1.95
25097354--25097514
87
1.9
87
85
0
223
25
33
15
25
1.95
25105421--25105552
29
4.6
29
94
0
219
25
32
15
26
1.95
25105392--25105552
58
2.8
58
88
0
187
25
33
15
25
1.95
25105392--25105552
87
1.9
87
85
0
223
25
33
15
25
1.95
25107407--25107829
27
15.6
27
85
5
505
40
9
22
27
1.84
25110563--25110602
20
2.0
21
90
5
64
52
10
17
20
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25113514--25113636
43
2.9
43
80
7
117
26
15
26
31
1.96
25117554--25117594
20
2.0
20
100
0
82
19
14
9
56
1.66
25125183--25125316
27
5.0
27
84
5
146
38
17
11
33
1.85
25125267--25125328
27
2.3
27
91
0
97
40
14
16
29
1.88
25142212--25142270
13
4.6
13
80
2
57
37
28
8
25
1.85
25144216--25144262
20
2.5
19
80
10
51
27
44
21
6
1.76
25144229--25144268
20
2.0
20
95
0
71
22
42
25
10
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6
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4
0
18
0.91
25145636--25145686
21
2.4
22
77
9
61
76
3
0
19
0.94
25160132--25160182
26
2.0
26
84
7
68
41
25
3
29
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378