Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9027963--9028163
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111
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21
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19
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23
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10
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2.2
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4.2
19
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30
1.23
9053118--9053197
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8.4
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70
19
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1
5
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1.23
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2.3
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175
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2
7
29
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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468
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261
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2.1
19
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5
51
28
0
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63
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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21
22
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9145666--9146518
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21
20
1.96
9145666--9146572
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1077
35
21
22
20
1.96
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349
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1000
35
21
22
20
1.96
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21
22
20
1.96
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88
2
285
28
24
21
26
1.99
9146841--9147630
132
6.0
132
97
0
1463
31
19
23
25
1.98
9147604--9147860
132
1.9
132
96
0
469
31
19
22
26
1.97
9146841--9147762
264
3.5
262
91
2
1395
31
19
23
25
1.98
9146900--9147840
176
5.3
176
81
5
1046
31
19
23
25
1.98
9148206--9148247
22
1.9
22
85
9
59
23
52
9
14
1.71
9148302--9148392
23
3.9
23
84
8
121
12
1
26
60
1.39
9148304--9148392
47
1.9
45
88
4
133
11
1
25
61
1.36
9148693--9148775
3
27.3
3
73
20
59
30
3
1
65
1.17
9148693--9148775
18
4.4
18
79
13
87
30
3
1
65
1.17
9148692--9148779
27
3.3
26
73
12
81
30
3
1
64
1.17
9148998--9149040
12
3.5
12
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3
50
37
0
4
58
1.19
9149128--9149163
2
18.0
2
88
0
54
47
2
0
50
1.15
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15
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39
14
0
46
1.45
9150290--9150356
35
1.9
35
84
6
91
38
4
8
47
1.55
9156434--9156477
19
2.4
18
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11
54
11
13
0
75
1.06
9158539--9158601
31
2.0
32
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34
20
1
42
1.62
9158524--9158585
31
2.0
31
87
0
88
32
22
0
45
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
76
39
0
0
60
0.97
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12
2.8
12
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17
50
63
0
36
0
0.95
9161093--9161131
17
2.4
17
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8
55
48
0
5
46
1.24
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2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
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2.0
21
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0
0
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1.00
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26
2.0
27
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0
7
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1.22
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21
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30
0
7
62
1.22
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20
2.0
20
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0
60
38
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10
28
1.87
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20
2.2
21
88
4
65
44
22
0
33
1.53
9170823--9170853
3
10.3
3
100
0
62
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0
0
35
0.94
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3
100
0
110
65
0
0
34
0.93
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9
3.7
9
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4
59
47
20
8
23
1.78
9176151--9176188
17
2.2
17
95
0
67
44
0
13
42
1.43
9176729--9176789
18
3.2
18
75
11
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50
6
31
11
1.64
9176733--9176794
27
2.3
26
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51
8
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1.63
9176754--9176794
21
2.0
21
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0
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53
9
29
7
1.60
9176729--9176764
6
6.0
6
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0
54
50
2
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13
1.57
9176742--9176794
12
4.2
12
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13
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52
7
30
9
1.61
9179158--9179213
28
2.0
28
96
0
103
28
12
28
30
1.93
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7.8
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13
53
0
54
0
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0.99
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2.0
84
90
0
272
31
8
17
42
1.78
9185824--9185849
13
2.0
13
100
0
52
30
0
7
61
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9185830--9185862
16
2.1
16
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11
50
24
0
6
69
1.10
9185764--9185967
105
1.9
105
89
3
313
41
5
10
42
1.63
9185926--9185968
14
3.1
14
86
6
52
34
2
4
58
1.32
9187424--9187455
2
16.0
2
100
0
64
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0
0
50
1.00
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3.1
21
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18
23
16
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1.90
9204420--9204507
42
2.1
42
80
4
97
18
21
18
42
1.90
9209808--9209874
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22.0
3
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3
125
32
0
1
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2
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0
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0
0
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1.00
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316
28
15
22
33
1.95
9222659--9222960
142
2.1
143
82
4
358
28
16
22
33
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378