Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  49  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12197558--12197596
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2.1
19
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55
2
19
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12212318--12212361
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2.1
21
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0.89
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5
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2.1
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29
2.4
29
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90
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0
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1.14
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2.2
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35
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2.2
16
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5
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13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
1
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1.07
12283024--12283101
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2.4
34
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10
99
16
6
1
75
1.07
12283020--12283117
29
3.6
26
82
10
92
16
8
1
74
1.11
12286005--12286037
13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
12291016--12291049
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0
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5
0
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4.2
26
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0
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25
35
1.84
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26
4.2
26
90
4
182
32
7
25
35
1.84
12305046--12305075
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2.1
14
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0
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43
10
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40
1.64
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2.0
18
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2.2
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247
18
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1.56
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19
3.1
19
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75
22
23
15
38
1.92
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2.6
275
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1185
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1.95
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0
1140
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16
21
30
1.95
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2.2
88
88
0
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479
28
16
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23
1.96
12317041--12317403
125
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16
31
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1.96
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1
544
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17
31
22
1.96
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44
4.5
45
83
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187
33
15
27
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1.95
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2.2
55
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2
83
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47
0
0
52
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12322362--12322401
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20.5
2
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50
0
0
50
1.00
12322399--12322470
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2.3
31
86
11
101
37
11
18
33
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12323628--12323662
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2.0
18
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5
54
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31
1.69
12327902--12327963
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2.3
27
91
2
99
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30
8
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1.78
12330904--12331000
3
32.3
3
83
4
124
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1
6
31
1.28
12332557--12333080
87
6.0
86
88
5
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21
24
19
34
1.96
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13
114
19
27
17
34
1.94
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43
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21
24
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0
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0
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17
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1.95
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89
89
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21
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1.95
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20
29
1.97
12375536--12375920
54
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68
21
207
26
21
19
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12375583--12375914
44
7.0
44
68
17
173
26
21
19
33
1.97
12375658--12375923
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2.7
98
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5
392
26
22
19
30
1.98
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46
3.1
46
82
2
169
25
26
14
33
1.94
12376863--12376963
53
1.9
53
93
0
175
54
7
16
20
1.67
12376864--12376954
26
3.4
27
68
20
66
54
8
15
20
1.67
12380702--12380746
19
2.3
20
88
7
67
42
13
22
22
1.88
12382689--12382992
3
102.7
3
76
9
252
62
1
5
29
1.30
12393019--12393186
40
4.2
40
75
3
140
25
27
20
26
1.99
12397576--12397729
76
2.0
76
92
2
256
31
5
20
41
1.76
12409411--12409498
21
4.0
23
73
10
76
39
23
21
14
1.91
12418179--12418204
13
2.0
13
100
0
52
84
0
0
15
0.62
12421375--12421422
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
12421470--12421525
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
12421459--12421525
20
3.3
20
93
0
116
34
11
20
32
1.90
12421575--12421742
23
7.1
23
91
5
264
29
21
20
29
1.98
12421955--12422017
30
2.1
30
93
0
108
36
15
23
23
1.94
12429586--12429641
11
5.5
11
71
16
57
35
12
19
32
1.89
12429575--12429641
20
3.3
20
93
0
116
34
11
20
32
1.90
12429691--12429854
23
7.1
23
90
5
251
29
21
20
28
1.98
12429690--12429854
45
3.6
46
94
2
287
29
21
20
28
1.98
12430068--12430128
31
2.0
31
93
0
104
32
16
26
24
1.96
12441163--12441220
29
2.0
28
93
3
98
31
17
22
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12442115--12442149
8
4.4
8
96
0
52
31
0
0
68
0.90
12446119--12446401
130
2.2
128
92
1
458
24
18
31
25
1.97
12446109--12446401
43
6.8
43
89
1
435
25
18
31
24
1.98
12446109--12446401
87
3.4
86
90
0
444
25
18
31
24
1.98
12446475--12446554
31
2.5
31
81
2
88
58
18
6
16
1.58
12451113--12451171
9
6.6
9
82
0
73
30
1
22
45
1.62
12451114--12451171
27
2.1
27
90
0
89
31
1
20
46
1.61
12451170--12451843
241
2.8
241
98
0
1296
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18
33
1.91
12451868--12451934
33
2.0
33
91
0
107
46
16
22
14
1.84
12455068--12455177
39
2.8
40
91
2
186
17
22
18
41
1.90
12455189--12455245
22
2.7
20
77
22
62
33
1
1
63
1.15
12455594--12455641
13
3.4
14
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8
53
35
47
0
16
1.47
12455594--12455647
14
3.9
14
85
7
65
37
46
0
16
1.48
12455645--12455704
14
4.2
14
75
10
50
46
28
1
23
1.62
12455666--12455716
7
7.1
7
84
4
57
49
25
0
25
1.51
12455666--12455716
14
3.6
14
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5
66
49
25
0
25
1.51
12455670--12455716
22
2.2
22
92
3
78
46
27
0
25
1.53
12456010--12456058
24
2.0
24
96
0
89
40
4
2
53
1.32
12457502--12457552
21
2.4
21
96
0
93
23
3
19
52
1.62
12457502--12457566
21
3.1
21
88
4
69
24
6
18
50
1.69
12461644--12461699
28
2.0
28
100
0
112
25
25
17
32
1.97
12462154--12462204
21
2.4
21
96
0
93
23
3
19
52
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12462154--12462218
21
3.1
21
88
4
69
24
6
18
50
1.69
12466710--12466736
13
2.1
13
100
0
54
48
14
14
22
1.81
12468077--12468134
22
2.6
22
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0
80
34
15
10
39
1.81
12470800--12470862
32
2.0
32
84
6
83
33
17
19
30
1.95
12473278--12473307
8
3.9
8
91
8
53
10
10
0
80
0.92
12473326--12473370
8
5.4
8
82
10
54
35
4
0
60
1.17
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16
3.8
16
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62
28
7
0
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1.21
12481054--12481094
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2.0
21
100
0
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12
0
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1.28
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2.5
22
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6
65
50
12
11
25
1.74
12484999--12485033
18
1.9
18
94
0
61
20
2
11
65
1.37

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378