Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  266  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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(0-2)
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1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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85
0
72
38
7
14
38
1.75
80039271--80039508
49
4.8
50
82
2
282
26
18
25
28
1.98
80049403--80049541
60
2.3
59
81
8
156
25
26
20
27
1.99
80051231--80051414
68
2.7
68
89
5
250
33
14
28
23
1.94
80051291--80051488
68
2.9
68
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7
192
33
15
29
21
1.94
80055849--80055893
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4.4
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13
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73
0
2
24
0.95
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19
2.1
19
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0
78
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10
5
35
1.59
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18
2.1
17
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5
54
66
0
2
30
1.06
80067093--80067154
25
2.3
27
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15
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69
0
25
4
1.08
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3
22.0
3
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3
29
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1.17
80070325--80070386
11
5.8
11
75
17
51
3
29
1
66
1.17
80070322--80070386
17
3.9
17
78
9
62
3
29
1
66
1.16
80070322--80070361
8
4.9
8
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11
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2
32
0
65
1.06
80070322--80070383
25
2.5
25
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29
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1.17
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2.00
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4
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26
24
25
23
2.00
80089231--80089376
40
3.7
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0
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23
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1.99
80089263--80089414
40
3.8
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3
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22
26
22
28
1.99
80097297--80097441
40
3.7
39
83
0
164
24
27
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.2
40
79
3
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23
26
23
27
2.00
80104745--80104894
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
80108661--80108828
40
4.2
40
79
3
160
23
26
23
27
2.00
80108677--80108826
80
1.9
80
83
8
198
22
26
24
27
1.99
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13
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1.88
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2
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0
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0
0
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176
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1.97
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353
2.3
354
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2
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30
1.97
80130977--80131114
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43
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25
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1.98
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2.1
89
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2
240
25
21
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28
1.99
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14
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0
12
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2
15
0
81
0.80
80132224--80132256
7
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7
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7
59
0
12
0
87
0.53
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13
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0
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0.53
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14
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14
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2
15
0
81
0.80
80132973--80133005
7
4.9
7
92
7
59
0
12
0
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0.53
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54
2.9
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2
199
15
18
17
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1.82
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2.0
749
99
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22
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1.9
30
89
0
89
29
24
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39
1.81
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47
9.3
47
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557
27
29
8
34
1.87
80141990--80142014
9
2.8
9
100
0
50
32
32
0
36
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80141943--80142105
56
3.1
56
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12
218
28
27
7
35
1.85
80142289--80142364
22
3.3
22
66
16
64
26
30
10
32
1.90
80143720--80144115
47
8.3
47
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29
8
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1.87
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9
2.8
9
100
0
50
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32
0
36
1.58
80143796--80144115
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3.4
93
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2
480
27
29
9
33
1.88
80143796--80144115
140
2.3
139
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1
478
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29
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1.88
80144037--80144112
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3.3
22
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235
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1.98
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2.6
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261
25
28
17
28
1.98
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48
5.0
48
93
2
399
30
28
6
34
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378