Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  32  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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780
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0
0
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4
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13
0
0
86
0.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7850237--7850279
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9
9
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44
2.4
44
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135
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23
14
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0
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13
2.5
13
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50
58
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20
1.59
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2.7
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1.15
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21
2.0
22
87
8
65
8
17
4
68
1.32
7916869--7916913
22
2.0
22
83
8
56
8
17
4
68
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
26
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3
41.3
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68
8
61
31
7
2
58
1.39
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18
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0
100
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0
40
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7977939--7978061
63
2.0
63
83
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19
23
26
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19
2.2
19
100
0
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26
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0
150
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25
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16
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0
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0
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6
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0
5
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1.25
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17
2.0
17
88
0
50
52
0
2
44
1.16
7990598--7990784
88
2.1
88
84
0
248
31
18
22
27
1.97
7992486--7992575
20
4.6
19
73
12
74
42
1
0
56
1.06
7993635--7993676
20
2.0
21
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4
68
0
21
2
76
0.90
7995579--7995751
46
3.7
46
80
7
181
28
20
28
23
1.99
8005736--8005775
20
2.0
20
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9
55
50
2
15
32
1.57
8009444--8009471
6
4.7
6
100
0
56
50
50
0
0
1.00
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29
2.1
29
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63
5
0
31
1.16
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29
2.2
29
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11
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31
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9
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1.59
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16
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17
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51
0
0
48
1.00
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13
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0
0
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19
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19
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50
1.20
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0
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31
2.0
31
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0
115
33
6
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38
1.79
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17
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17
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0
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4
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1.20
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30
22
21
26
1.99
8035599--8035646
7
6.7
7
76
4
51
20
0
29
50
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8035641--8035687
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3.2
15
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3
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14
2
46
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1.57
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7
3.7
7
100
0
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0
26
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1.56
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22
2.5
22
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74
1
1
22
1.02
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14
3.5
14
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2
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74
0
0
26
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14
3.1
15
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2
2
19
0.99
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22
3.0
21
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1
1
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2.1
40
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16
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1.72
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28
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60
1
1
35
1.19
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2.2
36
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3
3
29
1.29
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28
2.3
28
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45
3
1
50
1.27
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28
2.7
28
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10
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43
2
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1.23
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20
2.4
20
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39
0
0
60
0.97
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9
14.3
9
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31
2
0
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1.11
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10
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2.0
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0
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27
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27
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1.96
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8
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10
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4
23
26
45
1.71
8047712--8047755
16
2.8
16
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0
79
4
25
27
43
1.74
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5
7.0
5
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6
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2
0
22
0.94
8050957--8050997
15
2.6
16
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57
75
4
0
19
0.98
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16
1.9
16
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0
53
51
0
9
38
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8051771--8051835
28
2.3
27
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10
67
40
0
10
49
1.38
8054871--8054899
11
2.5
12
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5
51
20
6
0
72
1.07
8058429--8058487
28
2.1
29
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3
111
72
13
0
13
1.11
8063389--8063430
3
13.7
3
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5
75
33
2
0
64
1.07
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2.7
18
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58
0
0
42
0.98
8067929--8067980
15
3.1
17
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15
56
59
0
0
40
0.97
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2.1
24
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0
100
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38
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1.31
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2.4
12
100
0
58
34
0
17
48
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378