Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  96  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26203302--26203491
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26203302--26203491
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301
25
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1.92
26203301--26203491
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2.2
88
88
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24
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1.92
26211184--26211315
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2.3
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248
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24
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24
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22
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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28
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20
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5.9
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22
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108
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22
28
1.99
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3.5
48
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241
26
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29
1.99
26284148--26284313
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2.3
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21
22
28
1.99
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20
9
35
1.85
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11
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31
19
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1.89
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1.9
25
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25
14
25
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17.7
27
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9
22
27
1.85
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2.0
90
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1.84
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49
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31
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2.3
36
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5
147
20
19
33
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1.97
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2.0
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2.0
16
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0
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3
12
50
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.6
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118
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1.95
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1.71
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1.93
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3
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46
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26397243--26397267
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7
1
49
1.43
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15
1.9
15
100
0
58
20
6
34
37
1.80
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12
2.8
12
95
0
57
57
0
42
0
0.98
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13
2.8
13
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0
54
5
8
2
83
0.89
26416215--26416242
3
9.3
3
100
0
56
32
32
0
35
1.58
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14
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1.74
26423239--26423295
20
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20
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18
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20
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0
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2.0
20
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1.10
26427782--26427833
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5
0
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1.23
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39
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0
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1.94
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2.0
46
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0
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27
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1.22
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29
2.6
29
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1
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1.15
26449031--26449245
9
22.2
9
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32
3
1
62
1.21
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11
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10
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18
70
37
2
1
58
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
30
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7
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1
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86
2.5
89
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35
8
15
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1.78
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25
2.0
25
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20
6
36
1.78
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32
2.6
32
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11
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39
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3
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2.0
16
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0
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12
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37
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2.1
16
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1.94
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1.93
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25
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1.86
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1
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0
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2.2
43
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0
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0
0
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0
0
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11
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0
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2.7
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68
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2.8
28
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0
24
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20
1.9
20
88
0
58
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2
0
26
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26496359--26496418
26
2.3
26
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5
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1
1
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1.04
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2.6
27
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2
122
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27
14
28
1.95
26501680--26501724
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2.0
23
100
0
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17
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2.0
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6
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31
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2.4
14
90
0
50
32
11
23
32
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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