Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  317  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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39
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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29
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2.0
22
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8
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35
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11
46
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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86
39
1
23
35
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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20
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19
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0
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14
3.6
14
83
16
73
51
0
31
17
1.46
96600245--96600301
25
2.3
25
100
0
114
50
0
33
15
1.44
96599893--96600700
430
1.9
428
93
0
1409
40
15
19
25
1.90
96601389--96601450
31
2.0
31
96
0
115
46
19
14
19
1.83
96619702--96619747
23
2.0
23
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12
58
69
6
6
17
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96624339--96624368
14
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14
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0
51
50
40
0
10
1.36
96624339--96624370
8
4.2
8
84
15
50
50
40
0
9
1.35
96627486--96627529
18
2.5
18
85
10
56
43
0
2
54
1.12
96639739--96639772
15
2.3
15
100
0
68
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23
8
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1.86
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44
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3
151
48
14
23
13
1.79
96650340--96650454
3
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3
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16
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33
2
4
60
1.30
96650502--96650587
2
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2
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15
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39
1
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1.29
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25
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40
1
4
53
1.29
96650509--96650574
24
2.6
25
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1.24
96650508--96650640
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4
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1.36
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18
3.2
18
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2
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39
0
1
58
1.08
96650504--96650609
22
4.5
24
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20
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38
0
4
55
1.27
96650570--96650653
22
3.7
22
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18
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33
4
5
55
1.45
96650571--96650644
23
3.1
25
77
11
75
32
5
5
56
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
27
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12
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33
6
4
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1.45
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15
3.6
15
80
14
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32
3
3
59
1.33
96650987--96651031
3
14.3
3
81
9
54
35
0
2
62
1.08
96650993--96651070
23
4.2
19
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22
69
35
1
5
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1.29
96651112--96651161
25
2.0
26
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4
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1.31
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23
2.00
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2.00
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0
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0
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26
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2.7
46
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164
30
26
15
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5.8
31
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2
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26
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0
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51
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2
100
0
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0
0
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1.00
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44
1
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2.8
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49
0
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1.9
156
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47
3.1
47
92
0
240
32
10
29
27
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96715817--96715951
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2.8
48
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0
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3.9
37
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0
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26
1.98
96718983--96719146
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2.9
57
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1.53
96728881--96728928
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2.5
20
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0
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0
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0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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