Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  26  of  378  ( 45343 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6374108--6374395
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21
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6374121--6374498
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6374293--6374498
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220
27
19
19
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1.96
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2.0
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6388946--6389256
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3.0
104
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2
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1.95
6388950--6389257
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2.2
139
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0
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0
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0
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0
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0
0
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0.95
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2.7
23
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1
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1.20
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2.3
21
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1.58
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15
2.3
15
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10
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20
2
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1.21
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2.4
160
96
0
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17
21
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1.96
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3.5
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81
8
232
31
16
22
29
1.96
6423763--6424011
71
3.5
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7
239
31
16
22
29
1.96
6424060--6424233
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2.5
68
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0
321
25
14
18
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
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0
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15
0
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0
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0
0
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22
2.9
23
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3
3
60
1.27
6426393--6426441
21
2.3
21
79
6
55
32
12
4
51
1.58
6428364--6428418
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3.2
18
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7
87
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9
10
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1.69
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2.0
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5
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3.1
17
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12
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1
3
35
1.26
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10
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100
0
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2.2
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24
26
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10
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1.22
6442400--6442459
20
3.0
19
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9
84
68
1
6
23
1.22
6443100--6443277
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29
24
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1.95
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17
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0
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0
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88
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2
22
0.94
6444407--6444491
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23
52
74
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22
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6.5
50
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14
22
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1.93
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31
1.9
31
100
0
118
28
20
25
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
2.00
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10
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51
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2
7
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2.3
18
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55
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17
20
25
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0
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0
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1.94
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2.3
22
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59
38
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1.24
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5
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4
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0
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7
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6536137--6536168
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0
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38
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0
138
35
16
11
35
1.85
6560787--6560850
26
2.5
25
78
12
67
45
1
1
51
1.20
6562258--6562408
53
2.8
53
88
4
205
29
27
16
26
1.97
6563868--6563995
35
3.5
37
84
9
165
30
10
25
33
1.89
6563871--6564015
35
4.0
35
81
10
148
31
13
23
32
1.93
6563868--6564007
75
1.9
70
84
9
183
30
12
23
33
1.92
6564942--6565072
40
3.3
40
77
6
149
25
22
26
24
2.00
6572210--6572607
139
2.8
136
80
6
370
48
17
12
21
1.79
6572806--6572876
20
3.3
23
66
22
73
56
9
0
33
1.32
6572804--6572884
40
2.0
40
100
0
162
51
9
0
38
1.35
6575957--6575998
22
1.9
22
90
9
68
45
4
0
50
1.23
6576365--6576430
30
2.2
30
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5
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56
9
4
30
1.51
6577781--6577866
3
28.3
3
73
19
65
65
1
3
30
1.17
6577781--6577863
12
6.8
12
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16
73
65
1
3
30
1.17
6577786--6577866
18
4.4
18
79
13
76
65
1
3
29
1.17
6577781--6577867
27
3.4
27
71
19
78
65
1
3
29
1.16
6578197--6578243
21
2.2
21
88
3
67
65
25
0
8
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6578725--6578749
9
2.8
9
100
0
50
76
0
0
24
0.80
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26
2.2
26
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0
94
39
17
16
26
1.91
6598202--6598231
14
2.1
15
93
6
53
60
0
0
40
0.97
6598184--6598230
20
2.3
20
79
13
53
57
0
0
42
0.98
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17
2.4
16
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12
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2
0
20
0.90
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2.2
16
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0
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0
50
0
50
1.00
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6
0
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1.21
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3
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3
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2
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2.5
15
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2
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1.23
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72
84
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26
17
22
33
1.96
6609574--6609784
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3.1
66
82
10
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26
18
24
31
1.97
6609429--6609820
215
1.8
211
90
2
624
27
17
23
31
1.97
6609839--6609873
14
2.5
14
95
0
61
17
17
5
60
1.55
6609929--6609963
15
2.4
14
86
9
52
17
14
5
62
1.49
6609765--6610092
90
3.7
90
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6
387
28
16
19
35
1.93
6609766--6610121
178
2.0
178
88
1
534
28
16
19
36
1.93
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66
3.5
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13
280
28
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23
30
1.97
6610052--6610342
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4.0
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79
11
296
27
17
22
31
1.97
6610322--6610356
14
2.5
14
90
0
52
17
20
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57
1.60
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16
1.9
16
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0
53
16
12
6
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1.47
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2.6
87
83
8
286
26
16
19
38
1.92
6610556--6610585
13
2.3
13
94
0
51
16
6
6
70
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6610336--6610963
143
4.4
143
85
7
851
27
14
18
39
1.90
6610701--6610731
16
1.9
16
93
0
53
16
12
6
64
1.47
6610336--6610963
288
2.2
288
96
0
1161
27
14
18
39
1.90
6610844--6610873
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2.3
13
94
0
51
16
6
6
70
1.31
6610868--6611021
54
2.8
54
91
1
245
27
12
20
38
1.89
6610726--6611111
197
2.0
197
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548
28
14
19
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1.91
6612511--6612554
16
2.6
17
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13
65
0
45
0
54
0.99
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3
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7
122
31
4
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1.31
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2.5
15
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33
2
2
61
1.23
6616502--6616542
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378