Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  198  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
100
0
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26
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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21
29
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1.98
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1.98
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216
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.98
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21
29
28
1.98
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1.8
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1.98
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28
18
27
1.98
58518053--58518315
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250
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1.98
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2.6
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80
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59
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0
1
34
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58577420--58577511
8
10.6
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65
1.16
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10.2
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1.16
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24
0
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73
0.95
58580048--58580111
16
4.0
16
66
22
53
21
0
15
62
1.32
58590597--58590673
34
2.3
34
81
4
93
40
5
18
36
1.73
58591178--58591207
3
10.0
3
100
0
60
33
0
0
66
0.92
58597722--58597798
34
2.3
34
81
4
93
40
5
18
36
1.73
58597869--58598004
59
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61
79
5
161
32
11
25
30
1.92
58603675--58603726
27
1.9
28
84
7
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67
5
17
9
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58605513--58605731
40
5.5
39
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8
217
25
26
22
26
2.00
58605544--58605732
80
2.3
81
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2
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25
26
22
25
2.00
58614347--58614405
20
2.8
22
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10
77
38
28
25
6
1.81
58614472--58614540
21
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21
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58618041--58618068
10
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10
100
0
56
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0
17
60
1.36
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48
10.2
48
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0
847
30
26
6
36
1.82
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113
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113
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0
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5
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1.77
58619581--58619704
65
1.9
65
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0
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1.75
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0
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1.76
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19
1.9
19
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10
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0
27
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1.54
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2.2
21
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2
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1.46
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3
107
48
4
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40
1.48
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2
19.0
2
100
0
76
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
0
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12
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0
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1.76
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50
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50
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3
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20
26
1.98
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46
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47
75
12
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23
30
19
27
1.98
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27
27
19
24
1.99
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135
2.0
132
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2
366
27
27
19
24
1.99
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2.0
29
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1.61
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11
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1
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0
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1.94
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26
18
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26
1.98
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145
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555
26
18
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1.98
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42
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0
0
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1.00
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2.5
21
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0
59
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1.23
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22
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18
14
0
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12
2.8
12
86
4
50
51
9
3
36
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58697843--58697889
20
2.3
21
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3
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25
23
1.98
58699240--58699330
35
2.6
35
77
3
103
16
8
32
41
1.79
58701180--58701254
27
2.8
27
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33
14
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1.93
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40
4.7
40
89
1
270
25
29
21
23
1.99
58703657--58703864
80
2.6
79
88
3
301
26
29
20
23
1.99
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0
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0
0
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0
0
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0
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0.42
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2.2
18
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0
2
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90
0.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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