Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  228  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67415793--67415848
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14
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30
1.95
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19
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2.1
28
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20
40
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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124
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20
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28
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1.99
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283
27
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0
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0
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25
25
2.00
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2.0
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7
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25
22
26
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2.00
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20
15
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5.0
39
87
0
244
25
26
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.7
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15
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32
1.94
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2.0
187
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10
19
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1.86
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2.1
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94
0
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11
19
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1.86
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1.94
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1.9
45
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139
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503
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20
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1.88
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421
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10
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2.0
24
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1.94
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233
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22
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1.76
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21
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28
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8
175
24
22
6
46
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67564419--67564518
29
3.5
29
86
1
121
27
16
29
28
1.97
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30
0
13
56
1.37
67580557--67580665
45
2.3
46
87
7
150
33
10
29
27
1.89
67580736--67580820
40
2.2
40
84
2
109
17
22
31
28
1.97
67581320--67581344
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
67585135--67585327
40
4.8
40
89
1
264
25
27
20
26
1.99
67586583--67586623
21
2.0
21
85
9
57
36
26
2
34
1.70
67586594--67586633
21
1.9
21
84
0
53
37
25
2
35
1.69
67595960--67596034
29
2.6
29
89
4
107
26
16
32
25
1.96
67606329--67606429
28
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28
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114
29
13
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29
1.94
67612433--67612462
14
2.1
15
93
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53
36
3
6
53
1.44
67616971--67617020
23
2.2
23
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42
22
26
10
1.84
67619506--67619581
22
3.5
22
90
0
116
32
28
27
10
1.90
67619827--67619918
27
3.4
27
80
4
96
27
20
17
34
1.95
67625019--67625209
41
4.7
41
88
1
303
21
23
27
28
1.99
67625019--67625209
81
2.3
82
91
0
303
21
23
27
28
1.99
67628698--67628802
27
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27
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135
34
21
24
19
1.96
67629192--67629221
8
3.8
8
90
0
51
3
26
26
43
1.70
67630400--67630507
26
4.2
26
93
0
189
35
24
8
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1.85
67634569--67634618
25
2.0
25
100
0
100
24
24
20
32
1.98
67635517--67635615
33
3.0
33
89
0
153
19
10
39
31
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67642386--67642415
15
2.0
15
93
0
51
56
6
13
23
1.60
67653478--67653530
20
2.7
19
77
11
54
28
0
3
67
1.07
67653534--67653591
17
3.4
17
76
4
53
31
1
1
65
1.13
67653560--67653611
24
2.2
24
92
0
86
36
0
1
61
1.07
67653560--67653625
24
2.5
27
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9
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31
0
1
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1.01
67654332--67654378
24
2.0
24
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2
0
44
1.12
67660631--67660685
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21
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8
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20
34
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1.94
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20
2.0
20
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0
60
35
10
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1.50
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43
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43
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152
24
18
25
31
1.97
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13
110
25
18
25
30
1.98
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17
2.0
17
100
0
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35
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11
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17
2.5
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12
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34
15
10
39
1.82
67675919--67677029
132
8.4
132
94
0
1855
27
24
17
30
1.97
67677918--67677979
1
62.0
1
73
0
52
3
9
0
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0.66
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6
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3
10
0
86
0.67
67677918--67677979
11
5.5
11
78
17
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3
9
0
87
0.66
67677918--67677979
28
2.2
27
88
8
97
3
9
0
87
0.66
67677918--67677976
17
3.4
16
86
9
73
3
10
0
86
0.68
67681750--67681808
22
2.6
22
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5
74
1.13
67681855--67681894
21
1.9
21
85
10
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40
0
2
57
1.12
67682707--67682756
23
2.2
23
100
0
100
52
12
8
28
1.66
67683494--67683546
14
3.7
14
79
20
65
43
11
22
22
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67686013--67686182
93
1.8
93
93
2
297
28
30
20
20
1.98
67686004--67686179
46
3.8
46
78
14
191
30
30
19
19
1.97
67690403--67690561
29
5.5
29
86
8
198
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14
25
27
1.94
67698441--67698600
29
5.5
30
88
8
213
33
14
25
26
1.94
67698441--67698600
59
2.8
57
88
4
214
33
14
25
26
1.94
67701405--67701503
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28
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9
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29
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1.96
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3.5
28
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112
29
25
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0
0
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100
0
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0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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