Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  218  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.00
64737126--64737408
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12
24
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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19.9
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124
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2.7
30
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0
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1.08
64810131--64810176
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2
17
4
76
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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1.05
64811110--64811157
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2
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22
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1.97
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1.98
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17
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20
22
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64842058--64842122
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20
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20
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19
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1.94
64842516--64842612
31
3.1
31
90
0
140
17
19
14
48
1.81
64842535--64842621
6
14.2
6
73
17
72
18
18
14
48
1.82
64844583--64844685
27
3.8
27
84
2
116
31
24
8
35
1.86
64844582--64844687
55
1.9
54
84
1
140
30
24
9
35
1.87
64844638--64844696
27
2.2
27
84
0
73
35
27
6
30
1.83
64844680--64845778
27
40.6
27
86
6
1447
32
21
22
23
1.98
64845037--64845069
16
2.1
16
94
0
57
27
21
24
27
1.99
64845010--64845093
43
2.0
43
95
0
150
32
21
22
23
1.98
64846226--64846286
22
2.8
22
85
9
81
22
21
21
34
1.97
64846445--64846546
27
3.8
27
87
5
134
18
23
21
36
1.95
64846683--64846797
31
3.7
31
87
3
142
19
16
15
48
1.81
64846683--64846763
6
13.0
6
70
17
58
17
16
17
49
1.80
64848762--64848862
27
3.7
27
91
0
139
28
25
8
36
1.86
64848742--64848872
27
4.9
27
78
7
86
31
24
9
35
1.87
64848857--64849372
27
19.2
27
91
0
748
31
20
23
24
1.98
64849827--64849882
22
2.5
22
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11
60
19
21
21
37
1.94
64850049--64850150
27
3.8
26
80
5
96
20
21
20
37
1.95
64850287--64850397
31
3.5
31
88
1
150
20
17
12
49
1.79
64850287--64850406
6
19.3
6
67
19
50
20
16
13
49
1.79
64856607--64856750
38
3.7
38
90
3
209
18
20
27
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64860464--64860525
17
3.4
17
77
8
61
72
4
17
4
1.20
64860551--64860590
21
1.9
21
84
0
53
42
5
30
22
1.75
64864524--64864601
27
2.9
27
86
0
111
34
19
19
26
1.95
64864586--64864932
27
12.9
27
75
9
136
41
19
8
30
1.81
64864637--64864926
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3.6
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10
248
44
19
7
28
1.77
64864753--64864927
54
3.2
54
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7
185
44
18
7
29
1.77
64865194--64865238
19
2.4
19
100
0
90
17
20
31
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1.96
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30
3.2
30
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28
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29
1.95
64869737--64869913
67
2.6
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173
32
16
29
22
1.95
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2.8
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77
8
185
29
16
29
23
1.96
64876020--64876104
27
3.2
26
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5
98
38
17
23
20
1.93
64876296--64876321
11
2.4
11
100
0
52
34
19
7
38
1.80
64881880--64881918
18
2.1
18
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4
51
25
33
15
25
1.95
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19
2.2
19
86
0
55
24
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1.97
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27
4.2
27
85
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122
37
20
21
20
1.94
64892320--64892409
28
3.3
28
89
4
130
35
22
22
20
1.96
64892512--64892561
26
1.9
26
91
0
82
30
10
26
34
1.89
64898960--64899080
43
2.8
43
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12
131
33
29
14
22
1.94
64903080--64903251
46
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46
75
16
174
28
27
21
22
1.99
64903085--64903255
93
1.8
93
91
2
281
28
28
21
22
1.99
64911020--64911117
30
3.3
30
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0
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29
16
26
27
1.97
64911299--64911407
44
2.5
43
77
5
130
33
27
13
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64922497--64922533
14
2.7
14
95
4
67
10
8
8
72
1.27
64928757--64928876
46
2.6
46
86
2
152
29
16
30
23
1.96
64931097--64931121
12
2.1
12
100
0
50
40
16
16
28
1.89
64944605--64944640
17
2.1
17
89
5
54
19
25
36
19
1.95
64945270--64945311
21
2.0
21
85
0
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7
4
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38
1.51
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27
12.0
27
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353
41
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14
27
1.88
64947356--64947678
80
4.0
79
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2
398
40
16
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1.8
93
96
0
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20
1.98
64950273--64950453
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3.9
46
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9
233
27
29
21
20
1.98
64952801--64952889
30
3.0
30
79
11
94
56
15
17
10
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378