Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  269  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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1.95
80791682--80791757
29
2.7
28
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13
75
30
14
26
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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1.96
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245
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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23
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233
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21
19
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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19
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2.1
43
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2
146
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11
15
21
1.73
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3
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3
92
1
211
64
0
2
33
1.06
80931185--80931262
3
26.0
3
75
14
63
61
2
5
30
1.31
80931185--80931262
11
7.6
10
74
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2
5
30
1.31
80931232--80931271
20
2.0
21
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5
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62
2
0
35
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1
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80931404--80931451
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20
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38
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24
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23
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37
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0
173
23
18
30
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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1.97
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1.97
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1.98
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1.86
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0
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2.1
135
99
0
551
39
5
21
33
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81074656--81075013
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38
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22
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114
1.9
114
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0
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22
20
24
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45
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20
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1.99
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2.0
36
100
0
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0
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2.1
13
100
0
54
22
37
33
7
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378