Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr01 113035596 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113035596

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  176  of  378  ( 45343 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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25
1.39
51401708--51401743
18
2.0
18
100
0
72
38
27
5
27
1.79
51401882--51401942
30
2.0
30
100
0
122
37
0
26
36
1.57
51404638--51404671
5
6.8
5
100
0
68
58
0
0
41
0.98
51405160--51405216
23
2.3
26
88
8
84
42
0
0
57
0.98
51405170--51405210
18
2.3
19
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8
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46
0
0
53
1.00
51406701--51406859
85
1.9
85
80
2
185
23
25
33
17
1.96
51408355--51408382
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
51409057--51409093
2
18.5
2
100
0
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48
0
0
51
1.00
51411300--51411333
2
17.0
2
87
0
50
47
5
0
47
1.26
51413468--51413603
66
2.1
66
100
0
272
24
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7
38
1.82
51415912--51415954
22
2.0
22
85
0
59
11
16
4
67
1.38
51415937--51415971
16
2.1
17
89
5
54
17
11
0
71
1.14
51416318--51416379
30
2.1
30
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0
79
33
11
6
48
1.65
51417353--51417386
7
4.9
7
85
0
50
38
0
2
58
1.13
51419792--51419829
18
2.1
18
100
0
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26
7
31
34
1.85
51421604--51421654
19
2.7
19
90
0
84
19
37
21
21
1.95
51423510--51423796
48
6.0
48
84
0
367
28
28
16
27
1.97
51423474--51423796
96
3.4
96
85
1
425
27
28
16
27
1.97
51425029--51425200
46
3.7
46
83
9
183
27
19
31
21
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51428981--51429179
55
3.7
53
80
6
195
23
24
17
35
1.95
51436910--51436950
22
1.9
21
85
5
55
12
39
26
21
1.89
51438394--51438467
27
2.7
27
82
12
89
40
9
22
27
1.85
51447931--51447960
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
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3.1
42
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4
145
32
26
16
24
1.96
51461358--51461475
43
2.8
41
78
6
137
31
27
16
24
1.97
51463331--51463429
48
2.0
48
82
5
119
35
19
13
32
1.90
51465080--51465216
57
2.4
57
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7
145
30
16
23
29
1.96
51466948--51467058
34
3.3
34
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0
141
35
20
6
37
1.78
51473400--51473514
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2.7
41
79
11
133
24
20
25
30
1.98
51473394--51473555
43
3.8
42
75
12
150
25
17
25
31
1.97
51489230--51489402
55
3.2
54
80
7
174
21
23
17
36
1.94
51489230--51489413
54
3.4
54
80
6
203
21
23
17
37
1.94
51489392--51489512
46
2.6
47
86
2
181
26
22
13
38
1.91
51489392--51489646
47
5.5
45
75
8
190
24
22
16
36
1.94
51497070--51497236
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
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40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
51511093--51511286
39
4.9
39
87
0
244
23
21
31
23
1.98
51513758--51513813
23
2.5
22
82
8
67
21
10
3
64
1.40
51522103--51522135
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
51528413--51528652
27
8.9
26
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16
117
35
20
23
20
1.96
51528431--51528652
54
4.1
54
87
3
297
35
21
22
19
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51528431--51528652
81
2.7
81
86
5
290
35
21
22
19
1.96
51530267--51530373
26
4.2
26
89
4
164
36
22
7
33
1.82
51530267--51530373
51
2.1
52
92
1
180
36
22
7
33
1.82
51535470--51535601
29
4.6
29
83
1
149
25
32
16
25
1.96
51543423--51543529
39
2.7
38
83
11
119
21
28
26
23
1.99
51543423--51543572
40
3.8
39
76
10
126
22
26
24
26
2.00
51550218--51550366
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
51550259--51550366
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
51553455--51553573
19
6.2
19
69
17
77
35
6
0
57
1.31
51553455--51553500
21
2.3
19
82
10
56
39
4
0
56
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
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          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378